Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxa9P09631 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxa9P09631 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxa9P09631 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxa9P09631 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxa9P09631 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxa9P09631 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxa9P09631 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxa9P09631 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxa9P09631 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxa9P09631 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxa9P09631 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxa9P09631 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxa9P09631 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxa9P09631 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxa9P09631 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxa9P09631 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxa9P09631 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxa9P09631 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxa9P09631 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxa9P09631 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxa9P09631 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxa9P09631 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxa9P09631 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxa9P09631 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxa9P09631 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxa9P09631 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa9P09631 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa9P09631 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa9P09631 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa9P09631 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa9P09631 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa9P09631 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa9P09631 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa9P09631 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa9P09631 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa9P09631 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa9P09631 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa9P09631 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa9P09631 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa9P09631 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa9P09631 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa9P09631 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa9P09631 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxa9P09631 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxa9P09631 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxa9P09631 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxa9P09631 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxa9P09631 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxa9P09631 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxa9P09631 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxa9P09631 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxa9P09631 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxa9P09631 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxa9P09631 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxa9P09631 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxa9P09631 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa9P09631 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa9P09631 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa9P09631 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa9P09631 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxa9P09631 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxa9P09631 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxa9P09631 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa9P09631 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa9P09631 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa9P09631 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa9P09631 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxa9P09631 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxa9P09631 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxa9P09631 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxa9P09631 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxa9P09631 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxa9P09631 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxa9P09631 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxa9P09631 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxa9P09631 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxa9P09631 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxa9P09631 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxa9P09631 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxa9P09631 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxa9P09631 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxa9P09631 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxa9P09631 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxa9P09631 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxa9P09631 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxa9P09631 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxa9P09631 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxa9P09631 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxa9P09631 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxa9P09631 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxa9P09631 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxa9P09631 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxa9P09631 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxa9P09631 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxa9P09631 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxa9P09631 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxa9P09631 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxa9P09631 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxa9P09631 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms