Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apoa4P06728 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apoa4P06728 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apoa4P06728 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apoa4P06728 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apoa4P06728 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apoa4P06728 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apoa4P06728 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apoa4P06728 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Apoa4P06728 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apoa4P06728 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apoa4P06728 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apoa4P06728 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apoa4P06728 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apoa4P06728 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apoa4P06728 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apoa4P06728 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apoa4P06728 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apoa4P06728 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Apoa4P06728 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apoa4P06728 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apoa4P06728 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apoa4P06728 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apoa4P06728 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apoa4P06728 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apoa4P06728 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apoa4P06728 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apoa4P06728 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apoa4P06728 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apoa4P06728 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apoa4P06728 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apoa4P06728 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apoa4P06728 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apoa4P06728 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apoa4P06728 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apoa4P06728 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apoa4P06728 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apoa4P06728 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apoa4P06728 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apoa4P06728 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apoa4P06728 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apoa4P06728 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apoa4P06728 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apoa4P06728 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Apoa4P06728 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apoa4P06728 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apoa4P06728 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apoa4P06728 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apoa4P06728 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apoa4P06728 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apoa4P06728 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apoa4P06728 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apoa4P06728 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apoa4P06728 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apoa4P06728 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apoa4P06728 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apoa4P06728 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Apoa4P06728 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apoa4P06728 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apoa4P06728 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apoa4P06728 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apoa4P06728 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apoa4P06728 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apoa4P06728 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apoa4P06728 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apoa4P06728 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apoa4P06728 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apoa4P06728 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apoa4P06728 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apoa4P06728 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apoa4P06728 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apoa4P06728 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apoa4P06728 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apoa4P06728 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apoa4P06728 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apoa4P06728 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apoa4P06728 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apoa4P06728 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Apoa4P06728 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apoa4P06728 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apoa4P06728 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apoa4P06728 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apoa4P06728 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apoa4P06728 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apoa4P06728 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apoa4P06728 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apoa4P06728 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apoa4P06728 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apoa4P06728 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apoa4P06728 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apoa4P06728 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apoa4P06728 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Apoa4P06728 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apoa4P06728 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apoa4P06728 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apoa4P06728 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apoa4P06728 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apoa4P06728 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apoa4P06728 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apoa4P06728 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.6 ms