Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItgamP05555 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ItgamP05555 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ItgamP05555 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ItgamP05555 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ItgamP05555 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ItgamP05555 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ItgamP05555 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ItgamP05555 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ItgamP05555 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ItgamP05555 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ItgamP05555 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ItgamP05555 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ItgamP05555 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ItgamP05555 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ItgamP05555 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ItgamP05555 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ItgamP05555 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ItgamP05555 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ItgamP05555 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ItgamP05555 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ItgamP05555 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ItgamP05555 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ItgamP05555 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ItgamP05555 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ItgamP05555 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ItgamP05555 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ItgamP05555 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ItgamP05555 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ItgamP05555 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ItgamP05555 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ItgamP05555 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ItgamP05555 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ItgamP05555 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ItgamP05555 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ItgamP05555 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ItgamP05555 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ItgamP05555 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ItgamP05555 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ItgamP05555 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ItgamP05555 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ItgamP05555 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ItgamP05555 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ItgamP05555 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ItgamP05555 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ItgamP05555 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ItgamP05555 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ItgamP05555 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ItgamP05555 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ItgamP05555 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ItgamP05555 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ItgamP05555 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ItgamP05555 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ItgamP05555 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ItgamP05555 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ItgamP05555 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ItgamP05555 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ItgamP05555 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ItgamP05555 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ItgamP05555 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ItgamP05555 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ItgamP05555 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ItgamP05555 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ItgamP05555 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ItgamP05555 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ItgamP05555 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ItgamP05555 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ItgamP05555 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ItgamP05555 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ItgamP05555 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ItgamP05555 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ItgamP05555 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ItgamP05555 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ItgamP05555 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ItgamP05555 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ItgamP05555 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ItgamP05555 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ItgamP05555 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ItgamP05555 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ItgamP05555 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ItgamP05555 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ItgamP05555 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ItgamP05555 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ItgamP05555 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ItgamP05555 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ItgamP05555 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ItgamP05555 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ItgamP05555 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ItgamP05555 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ItgamP05555 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ItgamP05555 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ItgamP05555 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ItgamP05555 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ItgamP05555 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ItgamP05555 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ItgamP05555 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ItgamP05555 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ItgamP05555 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ItgamP05555 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ItgamP05555 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms