Protein–RNA interactions for Protein: P01790

Ig heavy chain V region M511, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01790 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01790 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01790 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01790 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01790 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01790 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01790 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01790 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
P01790 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01790 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01790 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01790 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01790 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01790 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01790 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01790 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01790 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01790 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
P01790 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01790 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01790 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01790 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01790 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01790 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01790 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01790 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01790 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01790 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01790 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01790 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01790 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01790 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01790 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01790 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01790 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01790 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01790 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01790 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01790 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01790 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01790 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01790 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01790 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01790 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01790 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01790 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01790 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01790 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01790 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01790 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01790 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01790 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01790 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01790 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01790 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01790 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01790 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01790 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01790 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01790 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01790 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01790 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01790 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01790 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01790 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01790 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01790 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01790 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01790 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01790 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01790 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01790 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01790 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01790 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01790 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01790 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01790 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01790 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01790 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01790 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01790 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01790 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
P01790 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01790 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01790 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01790 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01790 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01790 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01790 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01790 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01790 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01790 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01790 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01790 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01790 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01790 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01790 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01790 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01790 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01790 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.7 ms