Protein–RNA interactions for Protein: O88990

Actn3, Alpha-actinin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn3O88990 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Actn3O88990 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Actn3O88990 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Actn3O88990 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Actn3O88990 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Actn3O88990 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Actn3O88990 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Actn3O88990 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Actn3O88990 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Actn3O88990 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Actn3O88990 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Actn3O88990 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Actn3O88990 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Actn3O88990 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Actn3O88990 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Actn3O88990 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Actn3O88990 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Actn3O88990 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Actn3O88990 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Actn3O88990 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Actn3O88990 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Actn3O88990 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Actn3O88990 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Actn3O88990 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Actn3O88990 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Actn3O88990 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Actn3O88990 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Actn3O88990 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Actn3O88990 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Actn3O88990 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Actn3O88990 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Actn3O88990 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Actn3O88990 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Actn3O88990 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Actn3O88990 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Actn3O88990 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Actn3O88990 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Actn3O88990 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Actn3O88990 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Actn3O88990 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Actn3O88990 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Actn3O88990 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Actn3O88990 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Actn3O88990 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Actn3O88990 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Actn3O88990 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Actn3O88990 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Actn3O88990 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Actn3O88990 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Actn3O88990 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Actn3O88990 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Actn3O88990 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Actn3O88990 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Actn3O88990 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Actn3O88990 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Actn3O88990 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Actn3O88990 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Actn3O88990 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Actn3O88990 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Actn3O88990 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Actn3O88990 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Actn3O88990 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Actn3O88990 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Actn3O88990 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Actn3O88990 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Actn3O88990 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Actn3O88990 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Actn3O88990 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Actn3O88990 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Actn3O88990 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Actn3O88990 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Actn3O88990 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Actn3O88990 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Actn3O88990 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Actn3O88990 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Actn3O88990 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Actn3O88990 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Actn3O88990 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Actn3O88990 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Actn3O88990 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Actn3O88990 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Actn3O88990 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Actn3O88990 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Actn3O88990 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Actn3O88990 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Actn3O88990 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Actn3O88990 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Actn3O88990 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Actn3O88990 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Actn3O88990 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Actn3O88990 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Actn3O88990 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Actn3O88990 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Actn3O88990 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Actn3O88990 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Actn3O88990 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Actn3O88990 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Actn3O88990 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Actn3O88990 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Actn3O88990 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms