Protein–RNA interactions for Protein: O88986

Gcat, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcatO88986 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GcatO88986 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GcatO88986 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GcatO88986 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GcatO88986 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GcatO88986 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GcatO88986 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GcatO88986 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GcatO88986 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GcatO88986 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GcatO88986 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GcatO88986 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GcatO88986 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GcatO88986 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GcatO88986 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GcatO88986 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GcatO88986 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GcatO88986 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GcatO88986 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GcatO88986 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GcatO88986 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GcatO88986 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GcatO88986 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GcatO88986 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GcatO88986 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GcatO88986 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GcatO88986 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GcatO88986 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GcatO88986 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GcatO88986 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GcatO88986 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GcatO88986 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GcatO88986 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GcatO88986 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GcatO88986 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GcatO88986 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GcatO88986 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GcatO88986 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GcatO88986 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GcatO88986 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GcatO88986 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GcatO88986 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GcatO88986 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GcatO88986 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GcatO88986 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GcatO88986 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GcatO88986 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GcatO88986 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GcatO88986 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GcatO88986 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GcatO88986 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GcatO88986 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GcatO88986 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GcatO88986 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GcatO88986 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GcatO88986 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GcatO88986 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GcatO88986 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GcatO88986 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GcatO88986 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GcatO88986 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GcatO88986 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GcatO88986 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GcatO88986 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GcatO88986 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GcatO88986 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GcatO88986 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GcatO88986 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GcatO88986 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GcatO88986 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GcatO88986 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GcatO88986 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GcatO88986 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GcatO88986 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GcatO88986 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GcatO88986 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GcatO88986 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GcatO88986 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GcatO88986 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GcatO88986 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GcatO88986 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GcatO88986 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GcatO88986 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GcatO88986 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GcatO88986 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GcatO88986 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GcatO88986 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GcatO88986 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GcatO88986 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GcatO88986 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GcatO88986 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GcatO88986 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GcatO88986 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GcatO88986 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GcatO88986 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GcatO88986 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GcatO88986 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GcatO88986 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GcatO88986 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GcatO88986 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms