Protein–RNA interactions for Protein: O88907

Pias1, E3 SUMO-protein ligase PIAS1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pias1O88907 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pias1O88907 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pias1O88907 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pias1O88907 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pias1O88907 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Pias1O88907 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pias1O88907 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pias1O88907 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pias1O88907 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pias1O88907 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pias1O88907 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pias1O88907 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pias1O88907 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pias1O88907 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pias1O88907 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pias1O88907 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pias1O88907 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pias1O88907 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pias1O88907 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pias1O88907 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pias1O88907 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pias1O88907 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pias1O88907 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pias1O88907 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pias1O88907 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pias1O88907 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pias1O88907 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pias1O88907 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pias1O88907 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pias1O88907 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pias1O88907 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pias1O88907 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pias1O88907 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pias1O88907 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pias1O88907 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pias1O88907 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pias1O88907 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pias1O88907 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pias1O88907 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pias1O88907 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pias1O88907 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pias1O88907 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pias1O88907 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pias1O88907 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pias1O88907 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pias1O88907 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pias1O88907 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pias1O88907 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pias1O88907 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pias1O88907 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pias1O88907 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pias1O88907 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pias1O88907 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pias1O88907 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pias1O88907 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pias1O88907 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pias1O88907 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pias1O88907 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pias1O88907 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pias1O88907 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pias1O88907 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pias1O88907 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pias1O88907 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pias1O88907 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pias1O88907 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pias1O88907 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pias1O88907 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pias1O88907 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pias1O88907 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pias1O88907 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pias1O88907 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pias1O88907 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pias1O88907 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pias1O88907 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pias1O88907 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pias1O88907 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pias1O88907 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pias1O88907 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pias1O88907 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pias1O88907 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pias1O88907 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pias1O88907 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pias1O88907 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pias1O88907 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pias1O88907 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pias1O88907 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pias1O88907 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pias1O88907 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pias1O88907 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pias1O88907 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pias1O88907 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pias1O88907 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pias1O88907 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pias1O88907 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pias1O88907 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pias1O88907 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pias1O88907 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pias1O88907 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pias1O88907 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pias1O88907 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms