Protein–RNA interactions for Protein: O88855

Ltb4r, Leukotriene B4 receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltb4rO88855 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ltb4rO88855 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ltb4rO88855 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ltb4rO88855 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ltb4rO88855 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ltb4rO88855 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ltb4rO88855 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ltb4rO88855 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ltb4rO88855 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ltb4rO88855 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ltb4rO88855 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ltb4rO88855 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ltb4rO88855 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ltb4rO88855 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ltb4rO88855 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ltb4rO88855 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ltb4rO88855 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ltb4rO88855 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ltb4rO88855 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ltb4rO88855 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ltb4rO88855 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ltb4rO88855 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ltb4rO88855 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ltb4rO88855 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ltb4rO88855 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ltb4rO88855 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ltb4rO88855 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ltb4rO88855 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ltb4rO88855 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ltb4rO88855 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ltb4rO88855 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ltb4rO88855 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ltb4rO88855 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltb4rO88855 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ltb4rO88855 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ltb4rO88855 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ltb4rO88855 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ltb4rO88855 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ltb4rO88855 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ltb4rO88855 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ltb4rO88855 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltb4rO88855 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltb4rO88855 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltb4rO88855 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltb4rO88855 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltb4rO88855 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltb4rO88855 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltb4rO88855 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltb4rO88855 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltb4rO88855 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltb4rO88855 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltb4rO88855 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltb4rO88855 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltb4rO88855 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltb4rO88855 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltb4rO88855 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltb4rO88855 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltb4rO88855 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ltb4rO88855 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ltb4rO88855 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ltb4rO88855 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ltb4rO88855 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ltb4rO88855 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ltb4rO88855 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ltb4rO88855 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ltb4rO88855 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ltb4rO88855 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ltb4rO88855 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ltb4rO88855 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ltb4rO88855 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ltb4rO88855 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ltb4rO88855 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ltb4rO88855 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ltb4rO88855 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ltb4rO88855 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ltb4rO88855 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ltb4rO88855 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ltb4rO88855 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ltb4rO88855 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ltb4rO88855 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ltb4rO88855 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ltb4rO88855 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ltb4rO88855 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ltb4rO88855 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ltb4rO88855 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ltb4rO88855 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltb4rO88855 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltb4rO88855 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltb4rO88855 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltb4rO88855 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltb4rO88855 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ltb4rO88855 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ltb4rO88855 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ltb4rO88855 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltb4rO88855 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltb4rO88855 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltb4rO88855 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltb4rO88855 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltb4rO88855 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltb4rO88855 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms