Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctnnal1O88327 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctnnal1O88327 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctnnal1O88327 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctnnal1O88327 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctnnal1O88327 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctnnal1O88327 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctnnal1O88327 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctnnal1O88327 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctnnal1O88327 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctnnal1O88327 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctnnal1O88327 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctnnal1O88327 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctnnal1O88327 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctnnal1O88327 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctnnal1O88327 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctnnal1O88327 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctnnal1O88327 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctnnal1O88327 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctnnal1O88327 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctnnal1O88327 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctnnal1O88327 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctnnal1O88327 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctnnal1O88327 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctnnal1O88327 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctnnal1O88327 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctnnal1O88327 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctnnal1O88327 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctnnal1O88327 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctnnal1O88327 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ctnnal1O88327 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ctnnal1O88327 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ctnnal1O88327 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnnal1O88327 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnnal1O88327 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnnal1O88327 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnnal1O88327 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnnal1O88327 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctnnal1O88327 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctnnal1O88327 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctnnal1O88327 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctnnal1O88327 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctnnal1O88327 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctnnal1O88327 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctnnal1O88327 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctnnal1O88327 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctnnal1O88327 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctnnal1O88327 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctnnal1O88327 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctnnal1O88327 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctnnal1O88327 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctnnal1O88327 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctnnal1O88327 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctnnal1O88327 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctnnal1O88327 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctnnal1O88327 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctnnal1O88327 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctnnal1O88327 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctnnal1O88327 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctnnal1O88327 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctnnal1O88327 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctnnal1O88327 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctnnal1O88327 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctnnal1O88327 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctnnal1O88327 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctnnal1O88327 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctnnal1O88327 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctnnal1O88327 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctnnal1O88327 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctnnal1O88327 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctnnal1O88327 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctnnal1O88327 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctnnal1O88327 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctnnal1O88327 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctnnal1O88327 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctnnal1O88327 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctnnal1O88327 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctnnal1O88327 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctnnal1O88327 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctnnal1O88327 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctnnal1O88327 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctnnal1O88327 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctnnal1O88327 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctnnal1O88327 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctnnal1O88327 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctnnal1O88327 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctnnal1O88327 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctnnal1O88327 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctnnal1O88327 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctnnal1O88327 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctnnal1O88327 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ctnnal1O88327 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ctnnal1O88327 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ctnnal1O88327 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ctnnal1O88327 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctnnal1O88327 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctnnal1O88327 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctnnal1O88327 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctnnal1O88327 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctnnal1O88327 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms