Protein–RNA interactions for Protein: O70228

Atp9a, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9aO70228 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp9aO70228 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp9aO70228 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp9aO70228 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp9aO70228 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp9aO70228 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp9aO70228 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp9aO70228 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp9aO70228 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp9aO70228 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp9aO70228 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp9aO70228 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp9aO70228 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp9aO70228 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp9aO70228 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp9aO70228 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp9aO70228 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp9aO70228 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp9aO70228 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp9aO70228 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp9aO70228 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp9aO70228 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp9aO70228 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Atp9aO70228 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp9aO70228 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp9aO70228 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp9aO70228 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp9aO70228 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp9aO70228 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp9aO70228 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp9aO70228 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp9aO70228 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp9aO70228 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp9aO70228 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp9aO70228 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp9aO70228 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp9aO70228 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp9aO70228 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp9aO70228 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp9aO70228 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp9aO70228 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp9aO70228 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp9aO70228 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp9aO70228 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp9aO70228 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp9aO70228 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp9aO70228 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp9aO70228 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp9aO70228 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atp9aO70228 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp9aO70228 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp9aO70228 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp9aO70228 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp9aO70228 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp9aO70228 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp9aO70228 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp9aO70228 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp9aO70228 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp9aO70228 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp9aO70228 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp9aO70228 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp9aO70228 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp9aO70228 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp9aO70228 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp9aO70228 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp9aO70228 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp9aO70228 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp9aO70228 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp9aO70228 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp9aO70228 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp9aO70228 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp9aO70228 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp9aO70228 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp9aO70228 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp9aO70228 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp9aO70228 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp9aO70228 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp9aO70228 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp9aO70228 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp9aO70228 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp9aO70228 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp9aO70228 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp9aO70228 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp9aO70228 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp9aO70228 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp9aO70228 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp9aO70228 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp9aO70228 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp9aO70228 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp9aO70228 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp9aO70228 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp9aO70228 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp9aO70228 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp9aO70228 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp9aO70228 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp9aO70228 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp9aO70228 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp9aO70228 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp9aO70228 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp9aO70228 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms