Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bnc1O35914 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bnc1O35914 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bnc1O35914 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bnc1O35914 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bnc1O35914 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bnc1O35914 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bnc1O35914 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bnc1O35914 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bnc1O35914 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bnc1O35914 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bnc1O35914 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bnc1O35914 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bnc1O35914 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Bnc1O35914 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Bnc1O35914 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Bnc1O35914 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Bnc1O35914 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bnc1O35914 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bnc1O35914 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bnc1O35914 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Bnc1O35914 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bnc1O35914 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bnc1O35914 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bnc1O35914 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bnc1O35914 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bnc1O35914 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bnc1O35914 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bnc1O35914 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bnc1O35914 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bnc1O35914 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bnc1O35914 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bnc1O35914 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bnc1O35914 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bnc1O35914 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bnc1O35914 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bnc1O35914 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bnc1O35914 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bnc1O35914 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bnc1O35914 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bnc1O35914 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Bnc1O35914 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bnc1O35914 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Bnc1O35914 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Bnc1O35914 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Bnc1O35914 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bnc1O35914 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bnc1O35914 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bnc1O35914 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bnc1O35914 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bnc1O35914 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bnc1O35914 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bnc1O35914 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bnc1O35914 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bnc1O35914 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bnc1O35914 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bnc1O35914 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bnc1O35914 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bnc1O35914 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bnc1O35914 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bnc1O35914 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bnc1O35914 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bnc1O35914 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bnc1O35914 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bnc1O35914 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bnc1O35914 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bnc1O35914 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bnc1O35914 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bnc1O35914 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bnc1O35914 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bnc1O35914 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Bnc1O35914 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bnc1O35914 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bnc1O35914 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bnc1O35914 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bnc1O35914 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bnc1O35914 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bnc1O35914 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bnc1O35914 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bnc1O35914 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bnc1O35914 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bnc1O35914 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bnc1O35914 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bnc1O35914 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bnc1O35914 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bnc1O35914 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bnc1O35914 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bnc1O35914 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bnc1O35914 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bnc1O35914 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bnc1O35914 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bnc1O35914 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bnc1O35914 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bnc1O35914 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bnc1O35914 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bnc1O35914 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Bnc1O35914 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bnc1O35914 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bnc1O35914 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bnc1O35914 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms