Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CaluO35887 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CaluO35887 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CaluO35887 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CaluO35887 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CaluO35887 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CaluO35887 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CaluO35887 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CaluO35887 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CaluO35887 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CaluO35887 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CaluO35887 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CaluO35887 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CaluO35887 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CaluO35887 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CaluO35887 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CaluO35887 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CaluO35887 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CaluO35887 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CaluO35887 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CaluO35887 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CaluO35887 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CaluO35887 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CaluO35887 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CaluO35887 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CaluO35887 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CaluO35887 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CaluO35887 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CaluO35887 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CaluO35887 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CaluO35887 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CaluO35887 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CaluO35887 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CaluO35887 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CaluO35887 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CaluO35887 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CaluO35887 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CaluO35887 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CaluO35887 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CaluO35887 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CaluO35887 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CaluO35887 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CaluO35887 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CaluO35887 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CaluO35887 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CaluO35887 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CaluO35887 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CaluO35887 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CaluO35887 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CaluO35887 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CaluO35887 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CaluO35887 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CaluO35887 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CaluO35887 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CaluO35887 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CaluO35887 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CaluO35887 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CaluO35887 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CaluO35887 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CaluO35887 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CaluO35887 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CaluO35887 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CaluO35887 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CaluO35887 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CaluO35887 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CaluO35887 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CaluO35887 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CaluO35887 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CaluO35887 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CaluO35887 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CaluO35887 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CaluO35887 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CaluO35887 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CaluO35887 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CaluO35887 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CaluO35887 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CaluO35887 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CaluO35887 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CaluO35887 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CaluO35887 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CaluO35887 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CaluO35887 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CaluO35887 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CaluO35887 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CaluO35887 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CaluO35887 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CaluO35887 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CaluO35887 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CaluO35887 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CaluO35887 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CaluO35887 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CaluO35887 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CaluO35887 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CaluO35887 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CaluO35887 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CaluO35887 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CaluO35887 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CaluO35887 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CaluO35887 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CaluO35887 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176.5 ms