Protein–RNA interactions for Protein: O35448

Ppt2, Lysosomal thioesterase PPT2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppt2O35448 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppt2O35448 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppt2O35448 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppt2O35448 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppt2O35448 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppt2O35448 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppt2O35448 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppt2O35448 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppt2O35448 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppt2O35448 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppt2O35448 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppt2O35448 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppt2O35448 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppt2O35448 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppt2O35448 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppt2O35448 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppt2O35448 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppt2O35448 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppt2O35448 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppt2O35448 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppt2O35448 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppt2O35448 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppt2O35448 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppt2O35448 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppt2O35448 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppt2O35448 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppt2O35448 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppt2O35448 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppt2O35448 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppt2O35448 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ppt2O35448 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppt2O35448 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppt2O35448 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppt2O35448 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppt2O35448 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ppt2O35448 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppt2O35448 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppt2O35448 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppt2O35448 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppt2O35448 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppt2O35448 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppt2O35448 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppt2O35448 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppt2O35448 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppt2O35448 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppt2O35448 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppt2O35448 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppt2O35448 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppt2O35448 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppt2O35448 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppt2O35448 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppt2O35448 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppt2O35448 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppt2O35448 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppt2O35448 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppt2O35448 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppt2O35448 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppt2O35448 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppt2O35448 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppt2O35448 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppt2O35448 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppt2O35448 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppt2O35448 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppt2O35448 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ppt2O35448 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms