Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Polr1aO35134 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
Polr1aO35134 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Polr1aO35134 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Polr1aO35134 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Polr1aO35134 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Polr1aO35134 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Polr1aO35134 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Polr1aO35134 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Polr1aO35134 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Polr1aO35134 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Polr1aO35134 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Polr1aO35134 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Polr1aO35134 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Polr1aO35134 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Polr1aO35134 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Polr1aO35134 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Polr1aO35134 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Polr1aO35134 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Polr1aO35134 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Polr1aO35134 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Polr1aO35134 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Polr1aO35134 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Polr1aO35134 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Polr1aO35134 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Polr1aO35134 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Polr1aO35134 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Polr1aO35134 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Polr1aO35134 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Polr1aO35134 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Polr1aO35134 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Polr1aO35134 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Polr1aO35134 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Polr1aO35134 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Polr1aO35134 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Polr1aO35134 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Polr1aO35134 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Polr1aO35134 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Polr1aO35134 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Polr1aO35134 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Polr1aO35134 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Polr1aO35134 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Polr1aO35134 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Polr1aO35134 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Polr1aO35134 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Polr1aO35134 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Polr1aO35134 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Polr1aO35134 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
Polr1aO35134 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Polr1aO35134 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Polr1aO35134 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Polr1aO35134 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Polr1aO35134 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Polr1aO35134 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Polr1aO35134 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Polr1aO35134 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Polr1aO35134 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Polr1aO35134 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Polr1aO35134 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Polr1aO35134 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Polr1aO35134 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Polr1aO35134 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Polr1aO35134 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Polr1aO35134 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Polr1aO35134 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Polr1aO35134 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Polr1aO35134 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Polr1aO35134 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Polr1aO35134 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Polr1aO35134 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Polr1aO35134 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Polr1aO35134 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Polr1aO35134 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.35
Polr1aO35134 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
Polr1aO35134 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Polr1aO35134 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Polr1aO35134 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Polr1aO35134 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
Polr1aO35134 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Polr1aO35134 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Polr1aO35134 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Polr1aO35134 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Polr1aO35134 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Polr1aO35134 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Polr1aO35134 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Polr1aO35134 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Polr1aO35134 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Polr1aO35134 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Polr1aO35134 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Polr1aO35134 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Polr1aO35134 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Polr1aO35134 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Polr1aO35134 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Polr1aO35134 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Polr1aO35134 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Polr1aO35134 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Polr1aO35134 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Polr1aO35134 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Polr1aO35134 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Polr1aO35134 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms