Protein–RNA interactions for Protein: O09126

Sema4d, Semaphorin-4D, mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4dO09126 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sema4dO09126 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema4dO09126 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema4dO09126 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema4dO09126 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema4dO09126 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema4dO09126 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema4dO09126 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema4dO09126 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema4dO09126 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema4dO09126 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema4dO09126 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema4dO09126 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema4dO09126 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema4dO09126 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema4dO09126 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema4dO09126 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema4dO09126 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema4dO09126 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema4dO09126 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema4dO09126 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema4dO09126 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sema4dO09126 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sema4dO09126 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sema4dO09126 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sema4dO09126 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sema4dO09126 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema4dO09126 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema4dO09126 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema4dO09126 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema4dO09126 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema4dO09126 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema4dO09126 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema4dO09126 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema4dO09126 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema4dO09126 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema4dO09126 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema4dO09126 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema4dO09126 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema4dO09126 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema4dO09126 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema4dO09126 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sema4dO09126 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Sema4dO09126 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sema4dO09126 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sema4dO09126 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema4dO09126 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema4dO09126 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema4dO09126 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema4dO09126 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema4dO09126 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema4dO09126 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema4dO09126 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema4dO09126 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema4dO09126 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema4dO09126 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema4dO09126 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema4dO09126 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema4dO09126 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema4dO09126 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema4dO09126 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema4dO09126 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema4dO09126 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema4dO09126 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema4dO09126 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sema4dO09126 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sema4dO09126 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sema4dO09126 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema4dO09126 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema4dO09126 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema4dO09126 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema4dO09126 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema4dO09126 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema4dO09126 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema4dO09126 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema4dO09126 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema4dO09126 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sema4dO09126 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema4dO09126 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema4dO09126 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema4dO09126 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema4dO09126 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema4dO09126 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema4dO09126 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema4dO09126 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema4dO09126 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema4dO09126 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema4dO09126 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema4dO09126 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema4dO09126 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema4dO09126 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema4dO09126 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema4dO09126 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema4dO09126 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema4dO09126 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema4dO09126 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema4dO09126 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema4dO09126 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema4dO09126 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema4dO09126 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms