Protein–RNA interactions for Protein: O08848

Trove2, 60 kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trove2O08848 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trove2O08848 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Trove2O08848 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trove2O08848 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trove2O08848 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trove2O08848 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trove2O08848 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trove2O08848 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trove2O08848 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trove2O08848 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trove2O08848 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trove2O08848 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trove2O08848 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trove2O08848 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trove2O08848 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trove2O08848 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trove2O08848 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trove2O08848 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trove2O08848 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trove2O08848 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trove2O08848 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trove2O08848 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trove2O08848 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trove2O08848 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trove2O08848 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trove2O08848 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trove2O08848 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trove2O08848 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trove2O08848 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trove2O08848 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trove2O08848 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trove2O08848 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trove2O08848 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trove2O08848 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trove2O08848 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trove2O08848 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trove2O08848 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Trove2O08848 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trove2O08848 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trove2O08848 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trove2O08848 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trove2O08848 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trove2O08848 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trove2O08848 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trove2O08848 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trove2O08848 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Trove2O08848 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trove2O08848 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trove2O08848 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trove2O08848 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trove2O08848 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trove2O08848 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trove2O08848 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trove2O08848 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trove2O08848 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trove2O08848 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trove2O08848 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trove2O08848 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trove2O08848 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trove2O08848 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trove2O08848 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Trove2O08848 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trove2O08848 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trove2O08848 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trove2O08848 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trove2O08848 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trove2O08848 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trove2O08848 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trove2O08848 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trove2O08848 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trove2O08848 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trove2O08848 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trove2O08848 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trove2O08848 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trove2O08848 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trove2O08848 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trove2O08848 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trove2O08848 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trove2O08848 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trove2O08848 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trove2O08848 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trove2O08848 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trove2O08848 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trove2O08848 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trove2O08848 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trove2O08848 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trove2O08848 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trove2O08848 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trove2O08848 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trove2O08848 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trove2O08848 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trove2O08848 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trove2O08848 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trove2O08848 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trove2O08848 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trove2O08848 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trove2O08848 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trove2O08848 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trove2O08848 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trove2O08848 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms