Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3239L7N2D9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3239L7N2D9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm3239L7N2D9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3239L7N2D9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3239L7N2D9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3239L7N2D9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3239L7N2D9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3239L7N2D9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3239L7N2D9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3239L7N2D9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3239L7N2D9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3239L7N2D9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3239L7N2D9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3239L7N2D9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3239L7N2D9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3239L7N2D9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3239L7N2D9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3239L7N2D9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3239L7N2D9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3239L7N2D9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3239L7N2D9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3239L7N2D9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3239L7N2D9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3239L7N2D9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3239L7N2D9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3239L7N2D9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3239L7N2D9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3239L7N2D9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3239L7N2D9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3239L7N2D9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3239L7N2D9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3239L7N2D9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3239L7N2D9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3239L7N2D9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3239L7N2D9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3239L7N2D9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3239L7N2D9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3239L7N2D9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3239L7N2D9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3239L7N2D9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3239L7N2D9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3239L7N2D9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3239L7N2D9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3239L7N2D9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3239L7N2D9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3239L7N2D9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3239L7N2D9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3239L7N2D9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3239L7N2D9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3239L7N2D9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3239L7N2D9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3239L7N2D9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3239L7N2D9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3239L7N2D9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3239L7N2D9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3239L7N2D9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3239L7N2D9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3239L7N2D9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3239L7N2D9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm3239L7N2D9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm3239L7N2D9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm3239L7N2D9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm3239L7N2D9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3239L7N2D9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3239L7N2D9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3239L7N2D9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3239L7N2D9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3239L7N2D9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3239L7N2D9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3239L7N2D9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3239L7N2D9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3239L7N2D9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3239L7N2D9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3239L7N2D9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3239L7N2D9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3239L7N2D9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3239L7N2D9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3239L7N2D9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3239L7N2D9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3239L7N2D9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3239L7N2D9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3239L7N2D9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3239L7N2D9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3239L7N2D9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3239L7N2D9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3239L7N2D9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3239L7N2D9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gm3239L7N2D9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3239L7N2D9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3239L7N2D9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3239L7N2D9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3239L7N2D9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3239L7N2D9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3239L7N2D9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3239L7N2D9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3239L7N2D9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3239L7N2D9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3239L7N2D9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3239L7N2D9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms