Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms