Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC024978J3QPC3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC024978J3QPC3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BC024978J3QPC3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BC024978J3QPC3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BC024978J3QPC3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BC024978J3QPC3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BC024978J3QPC3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BC024978J3QPC3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BC024978J3QPC3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BC024978J3QPC3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC024978J3QPC3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BC024978J3QPC3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC024978J3QPC3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BC024978J3QPC3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BC024978J3QPC3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BC024978J3QPC3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BC024978J3QPC3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC024978J3QPC3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC024978J3QPC3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC024978J3QPC3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BC024978J3QPC3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BC024978J3QPC3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BC024978J3QPC3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BC024978J3QPC3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BC024978J3QPC3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BC024978J3QPC3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BC024978J3QPC3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BC024978J3QPC3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BC024978J3QPC3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BC024978J3QPC3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BC024978J3QPC3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BC024978J3QPC3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BC024978J3QPC3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BC024978J3QPC3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BC024978J3QPC3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BC024978J3QPC3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC024978J3QPC3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC024978J3QPC3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC024978J3QPC3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC024978J3QPC3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC024978J3QPC3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC024978J3QPC3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BC024978J3QPC3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BC024978J3QPC3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BC024978J3QPC3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BC024978J3QPC3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BC024978J3QPC3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BC024978J3QPC3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BC024978J3QPC3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BC024978J3QPC3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC024978J3QPC3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC024978J3QPC3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC024978J3QPC3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC024978J3QPC3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC024978J3QPC3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC024978J3QPC3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BC024978J3QPC3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC024978J3QPC3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC024978J3QPC3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC024978J3QPC3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC024978J3QPC3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC024978J3QPC3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC024978J3QPC3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC024978J3QPC3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC024978J3QPC3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC024978J3QPC3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC024978J3QPC3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC024978J3QPC3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC024978J3QPC3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC024978J3QPC3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC024978J3QPC3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BC024978J3QPC3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BC024978J3QPC3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BC024978J3QPC3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BC024978J3QPC3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BC024978J3QPC3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BC024978J3QPC3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BC024978J3QPC3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BC024978J3QPC3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC024978J3QPC3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC024978J3QPC3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC024978J3QPC3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC024978J3QPC3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BC024978J3QPC3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BC024978J3QPC3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BC024978J3QPC3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BC024978J3QPC3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC024978J3QPC3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC024978J3QPC3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC024978J3QPC3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC024978J3QPC3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC024978J3QPC3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC024978J3QPC3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BC024978J3QPC3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BC024978J3QPC3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BC024978J3QPC3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BC024978J3QPC3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BC024978J3QPC3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BC024978J3QPC3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms