Protein–RNA interactions for Protein: J3QJZ1

Gm21969, Predicted gene 21969, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21969J3QJZ1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm21969J3QJZ1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm21969J3QJZ1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm21969J3QJZ1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm21969J3QJZ1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm21969J3QJZ1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm21969J3QJZ1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm21969J3QJZ1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm21969J3QJZ1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm21969J3QJZ1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm21969J3QJZ1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm21969J3QJZ1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm21969J3QJZ1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm21969J3QJZ1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm21969J3QJZ1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm21969J3QJZ1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm21969J3QJZ1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm21969J3QJZ1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm21969J3QJZ1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm21969J3QJZ1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm21969J3QJZ1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm21969J3QJZ1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm21969J3QJZ1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm21969J3QJZ1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm21969J3QJZ1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm21969J3QJZ1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm21969J3QJZ1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm21969J3QJZ1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm21969J3QJZ1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm21969J3QJZ1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm21969J3QJZ1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm21969J3QJZ1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm21969J3QJZ1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm21969J3QJZ1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm21969J3QJZ1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm21969J3QJZ1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm21969J3QJZ1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm21969J3QJZ1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm21969J3QJZ1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm21969J3QJZ1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm21969J3QJZ1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm21969J3QJZ1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm21969J3QJZ1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm21969J3QJZ1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm21969J3QJZ1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm21969J3QJZ1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm21969J3QJZ1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm21969J3QJZ1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm21969J3QJZ1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm21969J3QJZ1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm21969J3QJZ1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm21969J3QJZ1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm21969J3QJZ1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm21969J3QJZ1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm21969J3QJZ1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm21969J3QJZ1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm21969J3QJZ1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm21969J3QJZ1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm21969J3QJZ1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm21969J3QJZ1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm21969J3QJZ1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm21969J3QJZ1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm21969J3QJZ1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm21969J3QJZ1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm21969J3QJZ1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm21969J3QJZ1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm21969J3QJZ1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm21969J3QJZ1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm21969J3QJZ1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm21969J3QJZ1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm21969J3QJZ1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm21969J3QJZ1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm21969J3QJZ1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm21969J3QJZ1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm21969J3QJZ1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm21969J3QJZ1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm21969J3QJZ1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm21969J3QJZ1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm21969J3QJZ1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm21969J3QJZ1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm21969J3QJZ1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm21969J3QJZ1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm21969J3QJZ1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm21969J3QJZ1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm21969J3QJZ1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm21969J3QJZ1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm21969J3QJZ1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm21969J3QJZ1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm21969J3QJZ1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm21969J3QJZ1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm21969J3QJZ1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm21969J3QJZ1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm21969J3QJZ1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm21969J3QJZ1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm21969J3QJZ1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm21969J3QJZ1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm21969J3QJZ1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm21969J3QJZ1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm21969J3QJZ1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm21969J3QJZ1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms