Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sh3tc1G3X9F6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sh3tc1G3X9F6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sh3tc1G3X9F6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sh3tc1G3X9F6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sh3tc1G3X9F6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sh3tc1G3X9F6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sh3tc1G3X9F6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sh3tc1G3X9F6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sh3tc1G3X9F6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sh3tc1G3X9F6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sh3tc1G3X9F6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sh3tc1G3X9F6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sh3tc1G3X9F6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sh3tc1G3X9F6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sh3tc1G3X9F6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sh3tc1G3X9F6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sh3tc1G3X9F6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sh3tc1G3X9F6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sh3tc1G3X9F6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sh3tc1G3X9F6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Sh3tc1G3X9F6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sh3tc1G3X9F6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sh3tc1G3X9F6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sh3tc1G3X9F6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sh3tc1G3X9F6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sh3tc1G3X9F6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Sh3tc1G3X9F6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sh3tc1G3X9F6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sh3tc1G3X9F6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Sh3tc1G3X9F6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sh3tc1G3X9F6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Sh3tc1G3X9F6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sh3tc1G3X9F6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Sh3tc1G3X9F6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Sh3tc1G3X9F6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sh3tc1G3X9F6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sh3tc1G3X9F6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sh3tc1G3X9F6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sh3tc1G3X9F6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sh3tc1G3X9F6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sh3tc1G3X9F6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sh3tc1G3X9F6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sh3tc1G3X9F6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sh3tc1G3X9F6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sh3tc1G3X9F6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sh3tc1G3X9F6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sh3tc1G3X9F6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sh3tc1G3X9F6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sh3tc1G3X9F6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sh3tc1G3X9F6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sh3tc1G3X9F6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sh3tc1G3X9F6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sh3tc1G3X9F6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sh3tc1G3X9F6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sh3tc1G3X9F6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sh3tc1G3X9F6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sh3tc1G3X9F6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sh3tc1G3X9F6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sh3tc1G3X9F6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sh3tc1G3X9F6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Sh3tc1G3X9F6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Sh3tc1G3X9F6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sh3tc1G3X9F6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sh3tc1G3X9F6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Sh3tc1G3X9F6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sh3tc1G3X9F6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sh3tc1G3X9F6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sh3tc1G3X9F6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sh3tc1G3X9F6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sh3tc1G3X9F6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sh3tc1G3X9F6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Sh3tc1G3X9F6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sh3tc1G3X9F6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sh3tc1G3X9F6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sh3tc1G3X9F6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sh3tc1G3X9F6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sh3tc1G3X9F6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Sh3tc1G3X9F6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Sh3tc1G3X9F6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sh3tc1G3X9F6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sh3tc1G3X9F6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sh3tc1G3X9F6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Sh3tc1G3X9F6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Sh3tc1G3X9F6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sh3tc1G3X9F6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sh3tc1G3X9F6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sh3tc1G3X9F6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Sh3tc1G3X9F6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sh3tc1G3X9F6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sh3tc1G3X9F6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sh3tc1G3X9F6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sh3tc1G3X9F6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms