Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zkscan2G3X952 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zkscan2G3X952 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Zkscan2G3X952 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Zkscan2G3X952 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Zkscan2G3X952 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Zkscan2G3X952 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Zkscan2G3X952 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Zkscan2G3X952 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Zkscan2G3X952 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Zkscan2G3X952 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Zkscan2G3X952 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Zkscan2G3X952 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zkscan2G3X952 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zkscan2G3X952 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zkscan2G3X952 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zkscan2G3X952 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zkscan2G3X952 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zkscan2G3X952 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zkscan2G3X952 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zkscan2G3X952 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Zkscan2G3X952 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Zkscan2G3X952 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Zkscan2G3X952 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Zkscan2G3X952 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Zkscan2G3X952 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Zkscan2G3X952 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zkscan2G3X952 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zkscan2G3X952 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zkscan2G3X952 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zkscan2G3X952 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zkscan2G3X952 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zkscan2G3X952 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zkscan2G3X952 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Zkscan2G3X952 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zkscan2G3X952 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zkscan2G3X952 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zkscan2G3X952 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zkscan2G3X952 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zkscan2G3X952 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zkscan2G3X952 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zkscan2G3X952 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Zkscan2G3X952 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zkscan2G3X952 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Zkscan2G3X952 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zkscan2G3X952 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zkscan2G3X952 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Zkscan2G3X952 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Zkscan2G3X952 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Zkscan2G3X952 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zkscan2G3X952 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zkscan2G3X952 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Zkscan2G3X952 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Zkscan2G3X952 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Zkscan2G3X952 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Zkscan2G3X952 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Zkscan2G3X952 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Zkscan2G3X952 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Zkscan2G3X952 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Zkscan2G3X952 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Zkscan2G3X952 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zkscan2G3X952 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zkscan2G3X952 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zkscan2G3X952 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Zkscan2G3X952 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Zkscan2G3X952 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Zkscan2G3X952 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Zkscan2G3X952 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Zkscan2G3X952 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zkscan2G3X952 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Zkscan2G3X952 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Zkscan2G3X952 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Zkscan2G3X952 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Zkscan2G3X952 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Zkscan2G3X952 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Zkscan2G3X952 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Zkscan2G3X952 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zkscan2G3X952 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zkscan2G3X952 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zkscan2G3X952 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zkscan2G3X952 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zkscan2G3X952 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zkscan2G3X952 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Zkscan2G3X952 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zkscan2G3X952 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zkscan2G3X952 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Zkscan2G3X952 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Zkscan2G3X952 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Zkscan2G3X952 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Zkscan2G3X952 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Zkscan2G3X952 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Zkscan2G3X952 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Zkscan2G3X952 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Zkscan2G3X952 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zkscan2G3X952 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zkscan2G3X952 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zkscan2G3X952 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zkscan2G3X952 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zkscan2G3X952 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zkscan2G3X952 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms