Protein–RNA interactions for Protein: F6Z6Z2

3110082J24Rik, RIKEN cDNA 3110082J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110082J24RikF6Z6Z2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
3110082J24RikF6Z6Z2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
3110082J24RikF6Z6Z2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
3110082J24RikF6Z6Z2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
3110082J24RikF6Z6Z2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
3110082J24RikF6Z6Z2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
3110082J24RikF6Z6Z2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
3110082J24RikF6Z6Z2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
3110082J24RikF6Z6Z2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
3110082J24RikF6Z6Z2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
3110082J24RikF6Z6Z2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
3110082J24RikF6Z6Z2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
3110082J24RikF6Z6Z2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
3110082J24RikF6Z6Z2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
3110082J24RikF6Z6Z2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
3110082J24RikF6Z6Z2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
3110082J24RikF6Z6Z2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
3110082J24RikF6Z6Z2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
3110082J24RikF6Z6Z2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
3110082J24RikF6Z6Z2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
3110082J24RikF6Z6Z2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
3110082J24RikF6Z6Z2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
3110082J24RikF6Z6Z2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
3110082J24RikF6Z6Z2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
3110082J24RikF6Z6Z2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
3110082J24RikF6Z6Z2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
3110082J24RikF6Z6Z2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
3110082J24RikF6Z6Z2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
3110082J24RikF6Z6Z2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
3110082J24RikF6Z6Z2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
3110082J24RikF6Z6Z2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
3110082J24RikF6Z6Z2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
3110082J24RikF6Z6Z2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
3110082J24RikF6Z6Z2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
3110082J24RikF6Z6Z2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
3110082J24RikF6Z6Z2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
3110082J24RikF6Z6Z2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
3110082J24RikF6Z6Z2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
3110082J24RikF6Z6Z2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
3110082J24RikF6Z6Z2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
3110082J24RikF6Z6Z2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
3110082J24RikF6Z6Z2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
3110082J24RikF6Z6Z2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
3110082J24RikF6Z6Z2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
3110082J24RikF6Z6Z2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
3110082J24RikF6Z6Z2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
3110082J24RikF6Z6Z2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
3110082J24RikF6Z6Z2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
3110082J24RikF6Z6Z2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
3110082J24RikF6Z6Z2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
3110082J24RikF6Z6Z2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
3110082J24RikF6Z6Z2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
3110082J24RikF6Z6Z2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
3110082J24RikF6Z6Z2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
3110082J24RikF6Z6Z2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
3110082J24RikF6Z6Z2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
3110082J24RikF6Z6Z2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
3110082J24RikF6Z6Z2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
3110082J24RikF6Z6Z2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
3110082J24RikF6Z6Z2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
3110082J24RikF6Z6Z2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
3110082J24RikF6Z6Z2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
3110082J24RikF6Z6Z2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
3110082J24RikF6Z6Z2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
3110082J24RikF6Z6Z2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
3110082J24RikF6Z6Z2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
3110082J24RikF6Z6Z2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
3110082J24RikF6Z6Z2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
3110082J24RikF6Z6Z2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
3110082J24RikF6Z6Z2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
3110082J24RikF6Z6Z2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
3110082J24RikF6Z6Z2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
3110082J24RikF6Z6Z2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
3110082J24RikF6Z6Z2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
3110082J24RikF6Z6Z2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
3110082J24RikF6Z6Z2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
3110082J24RikF6Z6Z2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
3110082J24RikF6Z6Z2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
3110082J24RikF6Z6Z2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
3110082J24RikF6Z6Z2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
3110082J24RikF6Z6Z2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
3110082J24RikF6Z6Z2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
3110082J24RikF6Z6Z2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
3110082J24RikF6Z6Z2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
3110082J24RikF6Z6Z2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
3110082J24RikF6Z6Z2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
3110082J24RikF6Z6Z2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
3110082J24RikF6Z6Z2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
3110082J24RikF6Z6Z2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
3110082J24RikF6Z6Z2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
3110082J24RikF6Z6Z2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123 ms