Protein–RNA interactions for Protein: F6W3F3

Gm21974, Predicted gene 21974 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21974F6W3F3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21974F6W3F3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21974F6W3F3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21974F6W3F3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21974F6W3F3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21974F6W3F3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21974F6W3F3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21974F6W3F3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21974F6W3F3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21974F6W3F3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21974F6W3F3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21974F6W3F3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21974F6W3F3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21974F6W3F3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21974F6W3F3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21974F6W3F3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21974F6W3F3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21974F6W3F3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21974F6W3F3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21974F6W3F3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21974F6W3F3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21974F6W3F3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21974F6W3F3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21974F6W3F3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21974F6W3F3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21974F6W3F3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21974F6W3F3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21974F6W3F3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21974F6W3F3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21974F6W3F3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21974F6W3F3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21974F6W3F3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21974F6W3F3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21974F6W3F3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21974F6W3F3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21974F6W3F3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21974F6W3F3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21974F6W3F3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21974F6W3F3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21974F6W3F3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21974F6W3F3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21974F6W3F3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21974F6W3F3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21974F6W3F3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21974F6W3F3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21974F6W3F3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21974F6W3F3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21974F6W3F3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21974F6W3F3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21974F6W3F3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21974F6W3F3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21974F6W3F3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21974F6W3F3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21974F6W3F3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21974F6W3F3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm21974F6W3F3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm21974F6W3F3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm21974F6W3F3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21974F6W3F3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21974F6W3F3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21974F6W3F3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21974F6W3F3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21974F6W3F3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21974F6W3F3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21974F6W3F3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21974F6W3F3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21974F6W3F3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21974F6W3F3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21974F6W3F3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21974F6W3F3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21974F6W3F3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21974F6W3F3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21974F6W3F3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21974F6W3F3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21974F6W3F3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21974F6W3F3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21974F6W3F3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21974F6W3F3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21974F6W3F3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21974F6W3F3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21974F6W3F3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21974F6W3F3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21974F6W3F3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21974F6W3F3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21974F6W3F3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21974F6W3F3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21974F6W3F3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21974F6W3F3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21974F6W3F3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21974F6W3F3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21974F6W3F3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21974F6W3F3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21974F6W3F3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21974F6W3F3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21974F6W3F3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21974F6W3F3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21974F6W3F3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21974F6W3F3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21974F6W3F3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21974F6W3F3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms