Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

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Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Herc6F2Z461 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Herc6F2Z461 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Herc6F2Z461 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Herc6F2Z461 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Herc6F2Z461 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Herc6F2Z461 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Herc6F2Z461 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Herc6F2Z461 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Herc6F2Z461 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Herc6F2Z461 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Herc6F2Z461 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Herc6F2Z461 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Herc6F2Z461 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Herc6F2Z461 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Herc6F2Z461 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Herc6F2Z461 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Herc6F2Z461 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Herc6F2Z461 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Herc6F2Z461 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Herc6F2Z461 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Herc6F2Z461 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Herc6F2Z461 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Herc6F2Z461 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Herc6F2Z461 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Herc6F2Z461 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Herc6F2Z461 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Herc6F2Z461 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Herc6F2Z461 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Herc6F2Z461 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Herc6F2Z461 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Herc6F2Z461 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Herc6F2Z461 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Herc6F2Z461 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Herc6F2Z461 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Herc6F2Z461 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Herc6F2Z461 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Herc6F2Z461 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Herc6F2Z461 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Herc6F2Z461 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Herc6F2Z461 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Herc6F2Z461 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Herc6F2Z461 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Herc6F2Z461 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Herc6F2Z461 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Herc6F2Z461 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Herc6F2Z461 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Herc6F2Z461 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Herc6F2Z461 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Herc6F2Z461 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Herc6F2Z461 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Herc6F2Z461 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Herc6F2Z461 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Herc6F2Z461 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Herc6F2Z461 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Herc6F2Z461 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Herc6F2Z461 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Herc6F2Z461 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Herc6F2Z461 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Herc6F2Z461 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Herc6F2Z461 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Herc6F2Z461 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Herc6F2Z461 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Herc6F2Z461 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Herc6F2Z461 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Herc6F2Z461 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Herc6F2Z461 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Herc6F2Z461 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Herc6F2Z461 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Herc6F2Z461 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Herc6F2Z461 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Herc6F2Z461 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Herc6F2Z461 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Herc6F2Z461 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Herc6F2Z461 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Herc6F2Z461 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Herc6F2Z461 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Herc6F2Z461 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Herc6F2Z461 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Herc6F2Z461 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Herc6F2Z461 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Herc6F2Z461 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Herc6F2Z461 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Herc6F2Z461 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Herc6F2Z461 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Herc6F2Z461 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Herc6F2Z461 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Herc6F2Z461 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Herc6F2Z461 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Herc6F2Z461 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Herc6F2Z461 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Herc6F2Z461 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Herc6F2Z461 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Herc6F2Z461 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Herc6F2Z461 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Herc6F2Z461 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Herc6F2Z461 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Herc6F2Z461 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Herc6F2Z461 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Herc6F2Z461 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms