Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm5407E9Q7Q1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm5407E9Q7Q1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm5407E9Q7Q1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm5407E9Q7Q1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm5407E9Q7Q1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm5407E9Q7Q1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm5407E9Q7Q1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
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Gm5407E9Q7Q1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm5407E9Q7Q1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm5407E9Q7Q1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5407E9Q7Q1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5407E9Q7Q1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5407E9Q7Q1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5407E9Q7Q1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5407E9Q7Q1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5407E9Q7Q1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5407E9Q7Q1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm5407E9Q7Q1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm5407E9Q7Q1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm5407E9Q7Q1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm5407E9Q7Q1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm5407E9Q7Q1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm5407E9Q7Q1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm5407E9Q7Q1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm5407E9Q7Q1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm5407E9Q7Q1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm5407E9Q7Q1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm5407E9Q7Q1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm5407E9Q7Q1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm5407E9Q7Q1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm5407E9Q7Q1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm5407E9Q7Q1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm5407E9Q7Q1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm5407E9Q7Q1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm5407E9Q7Q1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm5407E9Q7Q1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm5407E9Q7Q1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm5407E9Q7Q1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm5407E9Q7Q1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm5407E9Q7Q1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm5407E9Q7Q1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm5407E9Q7Q1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm5407E9Q7Q1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm5407E9Q7Q1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm5407E9Q7Q1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm5407E9Q7Q1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm5407E9Q7Q1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm5407E9Q7Q1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm5407E9Q7Q1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm5407E9Q7Q1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm5407E9Q7Q1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm5407E9Q7Q1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm5407E9Q7Q1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm5407E9Q7Q1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm5407E9Q7Q1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm5407E9Q7Q1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm5407E9Q7Q1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm5407E9Q7Q1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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Gm5407E9Q7Q1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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Gm5407E9Q7Q1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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Gm5407E9Q7Q1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm5407E9Q7Q1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm5407E9Q7Q1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm5407E9Q7Q1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm5407E9Q7Q1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm5407E9Q7Q1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm5407E9Q7Q1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm5407E9Q7Q1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm5407E9Q7Q1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
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Gm5407E9Q7Q1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm5407E9Q7Q1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm5407E9Q7Q1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Gm5407E9Q7Q1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Gm5407E9Q7Q1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm5407E9Q7Q1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm5407E9Q7Q1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm5407E9Q7Q1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm5407E9Q7Q1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm5407E9Q7Q1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm5407E9Q7Q1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm5407E9Q7Q1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm5407E9Q7Q1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm5407E9Q7Q1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm5407E9Q7Q1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm5407E9Q7Q1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm5407E9Q7Q1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm5407E9Q7Q1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm5407E9Q7Q1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm5407E9Q7Q1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm5407E9Q7Q1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm5407E9Q7Q1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm5407E9Q7Q1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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