Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7E4

Gm8882, Predicted gene 8882, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8882E9Q7E4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm8882E9Q7E4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm8882E9Q7E4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm8882E9Q7E4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm8882E9Q7E4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm8882E9Q7E4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm8882E9Q7E4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm8882E9Q7E4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm8882E9Q7E4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm8882E9Q7E4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm8882E9Q7E4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm8882E9Q7E4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm8882E9Q7E4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm8882E9Q7E4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm8882E9Q7E4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm8882E9Q7E4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm8882E9Q7E4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm8882E9Q7E4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm8882E9Q7E4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm8882E9Q7E4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm8882E9Q7E4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm8882E9Q7E4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm8882E9Q7E4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm8882E9Q7E4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm8882E9Q7E4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm8882E9Q7E4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm8882E9Q7E4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm8882E9Q7E4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm8882E9Q7E4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm8882E9Q7E4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm8882E9Q7E4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm8882E9Q7E4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm8882E9Q7E4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm8882E9Q7E4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm8882E9Q7E4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm8882E9Q7E4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm8882E9Q7E4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm8882E9Q7E4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm8882E9Q7E4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm8882E9Q7E4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm8882E9Q7E4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm8882E9Q7E4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm8882E9Q7E4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm8882E9Q7E4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm8882E9Q7E4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm8882E9Q7E4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm8882E9Q7E4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm8882E9Q7E4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm8882E9Q7E4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm8882E9Q7E4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm8882E9Q7E4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm8882E9Q7E4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm8882E9Q7E4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm8882E9Q7E4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm8882E9Q7E4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm8882E9Q7E4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm8882E9Q7E4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm8882E9Q7E4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm8882E9Q7E4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm8882E9Q7E4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm8882E9Q7E4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm8882E9Q7E4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm8882E9Q7E4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm8882E9Q7E4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm8882E9Q7E4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm8882E9Q7E4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm8882E9Q7E4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm8882E9Q7E4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm8882E9Q7E4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm8882E9Q7E4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm8882E9Q7E4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm8882E9Q7E4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm8882E9Q7E4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm8882E9Q7E4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm8882E9Q7E4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm8882E9Q7E4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm8882E9Q7E4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm8882E9Q7E4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm8882E9Q7E4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm8882E9Q7E4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm8882E9Q7E4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm8882E9Q7E4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm8882E9Q7E4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm8882E9Q7E4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm8882E9Q7E4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm8882E9Q7E4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm8882E9Q7E4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm8882E9Q7E4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm8882E9Q7E4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm8882E9Q7E4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm8882E9Q7E4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm8882E9Q7E4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm8882E9Q7E4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm8882E9Q7E4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm8882E9Q7E4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm8882E9Q7E4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm8882E9Q7E4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm8882E9Q7E4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm8882E9Q7E4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm8882E9Q7E4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms