Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4S1

Pde8b, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, mousemouse

Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde8bE9Q4S1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pde8bE9Q4S1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pde8bE9Q4S1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Pde8bE9Q4S1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pde8bE9Q4S1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pde8bE9Q4S1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pde8bE9Q4S1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pde8bE9Q4S1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pde8bE9Q4S1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pde8bE9Q4S1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pde8bE9Q4S1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pde8bE9Q4S1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pde8bE9Q4S1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pde8bE9Q4S1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pde8bE9Q4S1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pde8bE9Q4S1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pde8bE9Q4S1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pde8bE9Q4S1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pde8bE9Q4S1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pde8bE9Q4S1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pde8bE9Q4S1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pde8bE9Q4S1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pde8bE9Q4S1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pde8bE9Q4S1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pde8bE9Q4S1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pde8bE9Q4S1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pde8bE9Q4S1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pde8bE9Q4S1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pde8bE9Q4S1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pde8bE9Q4S1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pde8bE9Q4S1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pde8bE9Q4S1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pde8bE9Q4S1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pde8bE9Q4S1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pde8bE9Q4S1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pde8bE9Q4S1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pde8bE9Q4S1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pde8bE9Q4S1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pde8bE9Q4S1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pde8bE9Q4S1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pde8bE9Q4S1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pde8bE9Q4S1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pde8bE9Q4S1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pde8bE9Q4S1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pde8bE9Q4S1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pde8bE9Q4S1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pde8bE9Q4S1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pde8bE9Q4S1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Pde8bE9Q4S1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pde8bE9Q4S1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pde8bE9Q4S1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pde8bE9Q4S1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pde8bE9Q4S1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pde8bE9Q4S1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pde8bE9Q4S1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pde8bE9Q4S1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pde8bE9Q4S1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pde8bE9Q4S1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pde8bE9Q4S1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pde8bE9Q4S1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Pde8bE9Q4S1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pde8bE9Q4S1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pde8bE9Q4S1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pde8bE9Q4S1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pde8bE9Q4S1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pde8bE9Q4S1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pde8bE9Q4S1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Pde8bE9Q4S1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pde8bE9Q4S1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pde8bE9Q4S1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Pde8bE9Q4S1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Pde8bE9Q4S1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Pde8bE9Q4S1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pde8bE9Q4S1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Pde8bE9Q4S1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Pde8bE9Q4S1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pde8bE9Q4S1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Pde8bE9Q4S1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pde8bE9Q4S1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pde8bE9Q4S1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pde8bE9Q4S1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pde8bE9Q4S1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Pde8bE9Q4S1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pde8bE9Q4S1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Pde8bE9Q4S1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pde8bE9Q4S1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pde8bE9Q4S1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Pde8bE9Q4S1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pde8bE9Q4S1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pde8bE9Q4S1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pde8bE9Q4S1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pde8bE9Q4S1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pde8bE9Q4S1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Pde8bE9Q4S1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pde8bE9Q4S1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pde8bE9Q4S1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pde8bE9Q4S1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pde8bE9Q4S1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pde8bE9Q4S1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pde8bE9Q4S1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms