Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3J7

Gm3020, Predicted gene 3020, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3020E9Q3J7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3020E9Q3J7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3020E9Q3J7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3020E9Q3J7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3020E9Q3J7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3020E9Q3J7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3020E9Q3J7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3020E9Q3J7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3020E9Q3J7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3020E9Q3J7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3020E9Q3J7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3020E9Q3J7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3020E9Q3J7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3020E9Q3J7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3020E9Q3J7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3020E9Q3J7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3020E9Q3J7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3020E9Q3J7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3020E9Q3J7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3020E9Q3J7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3020E9Q3J7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3020E9Q3J7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3020E9Q3J7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3020E9Q3J7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3020E9Q3J7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3020E9Q3J7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3020E9Q3J7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3020E9Q3J7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3020E9Q3J7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3020E9Q3J7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm3020E9Q3J7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3020E9Q3J7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3020E9Q3J7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3020E9Q3J7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3020E9Q3J7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3020E9Q3J7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3020E9Q3J7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3020E9Q3J7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3020E9Q3J7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3020E9Q3J7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3020E9Q3J7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3020E9Q3J7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3020E9Q3J7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3020E9Q3J7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3020E9Q3J7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3020E9Q3J7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3020E9Q3J7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3020E9Q3J7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3020E9Q3J7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3020E9Q3J7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3020E9Q3J7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3020E9Q3J7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3020E9Q3J7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3020E9Q3J7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3020E9Q3J7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm3020E9Q3J7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3020E9Q3J7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3020E9Q3J7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3020E9Q3J7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3020E9Q3J7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3020E9Q3J7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3020E9Q3J7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3020E9Q3J7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3020E9Q3J7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3020E9Q3J7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3020E9Q3J7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3020E9Q3J7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3020E9Q3J7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3020E9Q3J7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3020E9Q3J7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3020E9Q3J7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3020E9Q3J7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3020E9Q3J7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3020E9Q3J7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3020E9Q3J7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3020E9Q3J7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3020E9Q3J7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3020E9Q3J7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm3020E9Q3J7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3020E9Q3J7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3020E9Q3J7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3020E9Q3J7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3020E9Q3J7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3020E9Q3J7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3020E9Q3J7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3020E9Q3J7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3020E9Q3J7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3020E9Q3J7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3020E9Q3J7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3020E9Q3J7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3020E9Q3J7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3020E9Q3J7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3020E9Q3J7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3020E9Q3J7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3020E9Q3J7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3020E9Q3J7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3020E9Q3J7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3020E9Q3J7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3020E9Q3J7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3020E9Q3J7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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