Protein–RNA interactions for Protein: E9Q309

Cep350, Centrosome-associated protein 350, mousemouse

Predictions only

Length 3,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep350E9Q309 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cep350E9Q309 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cep350E9Q309 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cep350E9Q309 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cep350E9Q309 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cep350E9Q309 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep350E9Q309 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep350E9Q309 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep350E9Q309 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cep350E9Q309 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cep350E9Q309 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cep350E9Q309 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep350E9Q309 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep350E9Q309 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep350E9Q309 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep350E9Q309 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep350E9Q309 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep350E9Q309 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep350E9Q309 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep350E9Q309 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep350E9Q309 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep350E9Q309 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep350E9Q309 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep350E9Q309 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep350E9Q309 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep350E9Q309 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep350E9Q309 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep350E9Q309 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep350E9Q309 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep350E9Q309 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep350E9Q309 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cep350E9Q309 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cep350E9Q309 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cep350E9Q309 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep350E9Q309 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep350E9Q309 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep350E9Q309 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep350E9Q309 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep350E9Q309 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep350E9Q309 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep350E9Q309 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep350E9Q309 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep350E9Q309 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep350E9Q309 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep350E9Q309 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep350E9Q309 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep350E9Q309 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep350E9Q309 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cep350E9Q309 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cep350E9Q309 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cep350E9Q309 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cep350E9Q309 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cep350E9Q309 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep350E9Q309 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep350E9Q309 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep350E9Q309 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep350E9Q309 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep350E9Q309 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep350E9Q309 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep350E9Q309 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep350E9Q309 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep350E9Q309 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cep350E9Q309 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cep350E9Q309 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cep350E9Q309 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cep350E9Q309 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cep350E9Q309 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cep350E9Q309 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cep350E9Q309 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cep350E9Q309 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cep350E9Q309 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cep350E9Q309 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cep350E9Q309 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cep350E9Q309 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cep350E9Q309 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep350E9Q309 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep350E9Q309 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep350E9Q309 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep350E9Q309 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep350E9Q309 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep350E9Q309 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep350E9Q309 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep350E9Q309 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep350E9Q309 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep350E9Q309 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep350E9Q309 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep350E9Q309 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep350E9Q309 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep350E9Q309 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep350E9Q309 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep350E9Q309 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep350E9Q309 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cep350E9Q309 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cep350E9Q309 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Cep350E9Q309 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep350E9Q309 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cep350E9Q309 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cep350E9Q309 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cep350E9Q309 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cep350E9Q309 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms