Protein–RNA interactions for Protein: E9Q048

Ermard, ER membrane-associated RNA degradation, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErmardE9Q048 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ErmardE9Q048 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ErmardE9Q048 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ErmardE9Q048 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ErmardE9Q048 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ErmardE9Q048 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ErmardE9Q048 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ErmardE9Q048 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ErmardE9Q048 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ErmardE9Q048 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ErmardE9Q048 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ErmardE9Q048 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ErmardE9Q048 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ErmardE9Q048 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ErmardE9Q048 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ErmardE9Q048 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ErmardE9Q048 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ErmardE9Q048 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ErmardE9Q048 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ErmardE9Q048 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ErmardE9Q048 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ErmardE9Q048 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ErmardE9Q048 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ErmardE9Q048 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ErmardE9Q048 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ErmardE9Q048 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ErmardE9Q048 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ErmardE9Q048 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ErmardE9Q048 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ErmardE9Q048 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ErmardE9Q048 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ErmardE9Q048 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ErmardE9Q048 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ErmardE9Q048 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ErmardE9Q048 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ErmardE9Q048 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ErmardE9Q048 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ErmardE9Q048 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ErmardE9Q048 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ErmardE9Q048 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ErmardE9Q048 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ErmardE9Q048 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ErmardE9Q048 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ErmardE9Q048 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ErmardE9Q048 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ErmardE9Q048 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ErmardE9Q048 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ErmardE9Q048 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ErmardE9Q048 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ErmardE9Q048 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ErmardE9Q048 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ErmardE9Q048 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ErmardE9Q048 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ErmardE9Q048 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ErmardE9Q048 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ErmardE9Q048 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ErmardE9Q048 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ErmardE9Q048 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ErmardE9Q048 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ErmardE9Q048 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ErmardE9Q048 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ErmardE9Q048 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ErmardE9Q048 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ErmardE9Q048 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ErmardE9Q048 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ErmardE9Q048 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ErmardE9Q048 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ErmardE9Q048 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ErmardE9Q048 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ErmardE9Q048 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ErmardE9Q048 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ErmardE9Q048 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ErmardE9Q048 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ErmardE9Q048 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ErmardE9Q048 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ErmardE9Q048 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ErmardE9Q048 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ErmardE9Q048 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ErmardE9Q048 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ErmardE9Q048 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ErmardE9Q048 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ErmardE9Q048 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ErmardE9Q048 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ErmardE9Q048 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ErmardE9Q048 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ErmardE9Q048 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ErmardE9Q048 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ErmardE9Q048 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ErmardE9Q048 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ErmardE9Q048 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ErmardE9Q048 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ErmardE9Q048 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ErmardE9Q048 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ErmardE9Q048 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ErmardE9Q048 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ErmardE9Q048 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ErmardE9Q048 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ErmardE9Q048 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ErmardE9Q048 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ErmardE9Q048 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms