Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FgaE9PV24 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FgaE9PV24 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FgaE9PV24 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FgaE9PV24 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FgaE9PV24 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FgaE9PV24 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FgaE9PV24 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FgaE9PV24 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FgaE9PV24 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FgaE9PV24 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FgaE9PV24 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FgaE9PV24 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FgaE9PV24 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FgaE9PV24 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FgaE9PV24 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FgaE9PV24 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FgaE9PV24 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FgaE9PV24 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FgaE9PV24 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FgaE9PV24 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FgaE9PV24 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FgaE9PV24 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FgaE9PV24 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FgaE9PV24 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FgaE9PV24 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FgaE9PV24 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FgaE9PV24 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FgaE9PV24 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FgaE9PV24 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FgaE9PV24 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FgaE9PV24 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FgaE9PV24 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FgaE9PV24 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FgaE9PV24 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FgaE9PV24 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FgaE9PV24 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FgaE9PV24 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FgaE9PV24 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FgaE9PV24 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FgaE9PV24 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
FgaE9PV24 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FgaE9PV24 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FgaE9PV24 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FgaE9PV24 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FgaE9PV24 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FgaE9PV24 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FgaE9PV24 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FgaE9PV24 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FgaE9PV24 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FgaE9PV24 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FgaE9PV24 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FgaE9PV24 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FgaE9PV24 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FgaE9PV24 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FgaE9PV24 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FgaE9PV24 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FgaE9PV24 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FgaE9PV24 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FgaE9PV24 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FgaE9PV24 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FgaE9PV24 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FgaE9PV24 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FgaE9PV24 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FgaE9PV24 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FgaE9PV24 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FgaE9PV24 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FgaE9PV24 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FgaE9PV24 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FgaE9PV24 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FgaE9PV24 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FgaE9PV24 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FgaE9PV24 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FgaE9PV24 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FgaE9PV24 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FgaE9PV24 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FgaE9PV24 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FgaE9PV24 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FgaE9PV24 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FgaE9PV24 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FgaE9PV24 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FgaE9PV24 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FgaE9PV24 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FgaE9PV24 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FgaE9PV24 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FgaE9PV24 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FgaE9PV24 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FgaE9PV24 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FgaE9PV24 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FgaE9PV24 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FgaE9PV24 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FgaE9PV24 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FgaE9PV24 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FgaE9PV24 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FgaE9PV24 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FgaE9PV24 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FgaE9PV24 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FgaE9PV24 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FgaE9PV24 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FgaE9PV24 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms