Protein–RNA interactions for Protein: D3Z741

4930444G20Rik, RIKEN cDNA 4930444G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444G20RikD3Z741 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930444G20RikD3Z741 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930444G20RikD3Z741 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930444G20RikD3Z741 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4930444G20RikD3Z741 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
4930444G20RikD3Z741 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
4930444G20RikD3Z741 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930444G20RikD3Z741 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930444G20RikD3Z741 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930444G20RikD3Z741 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930444G20RikD3Z741 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930444G20RikD3Z741 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
4930444G20RikD3Z741 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930444G20RikD3Z741 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
4930444G20RikD3Z741 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
4930444G20RikD3Z741 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
4930444G20RikD3Z741 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
4930444G20RikD3Z741 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4930444G20RikD3Z741 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4930444G20RikD3Z741 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
4930444G20RikD3Z741 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4930444G20RikD3Z741 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
4930444G20RikD3Z741 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
4930444G20RikD3Z741 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4930444G20RikD3Z741 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4930444G20RikD3Z741 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4930444G20RikD3Z741 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4930444G20RikD3Z741 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
4930444G20RikD3Z741 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
4930444G20RikD3Z741 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4930444G20RikD3Z741 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930444G20RikD3Z741 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
4930444G20RikD3Z741 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930444G20RikD3Z741 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930444G20RikD3Z741 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930444G20RikD3Z741 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930444G20RikD3Z741 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930444G20RikD3Z741 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
4930444G20RikD3Z741 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4930444G20RikD3Z741 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930444G20RikD3Z741 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930444G20RikD3Z741 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930444G20RikD3Z741 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930444G20RikD3Z741 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4930444G20RikD3Z741 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4930444G20RikD3Z741 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4930444G20RikD3Z741 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
4930444G20RikD3Z741 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4930444G20RikD3Z741 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
4930444G20RikD3Z741 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4930444G20RikD3Z741 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930444G20RikD3Z741 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930444G20RikD3Z741 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930444G20RikD3Z741 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930444G20RikD3Z741 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930444G20RikD3Z741 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930444G20RikD3Z741 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
4930444G20RikD3Z741 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930444G20RikD3Z741 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930444G20RikD3Z741 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
4930444G20RikD3Z741 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
4930444G20RikD3Z741 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4930444G20RikD3Z741 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930444G20RikD3Z741 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930444G20RikD3Z741 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930444G20RikD3Z741 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930444G20RikD3Z741 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930444G20RikD3Z741 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930444G20RikD3Z741 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930444G20RikD3Z741 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930444G20RikD3Z741 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930444G20RikD3Z741 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930444G20RikD3Z741 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930444G20RikD3Z741 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930444G20RikD3Z741 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930444G20RikD3Z741 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930444G20RikD3Z741 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930444G20RikD3Z741 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930444G20RikD3Z741 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930444G20RikD3Z741 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930444G20RikD3Z741 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930444G20RikD3Z741 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930444G20RikD3Z741 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930444G20RikD3Z741 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930444G20RikD3Z741 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930444G20RikD3Z741 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
4930444G20RikD3Z741 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930444G20RikD3Z741 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930444G20RikD3Z741 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930444G20RikD3Z741 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930444G20RikD3Z741 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930444G20RikD3Z741 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930444G20RikD3Z741 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930444G20RikD3Z741 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
4930444G20RikD3Z741 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930444G20RikD3Z741 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930444G20RikD3Z741 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930444G20RikD3Z741 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930444G20RikD3Z741 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930444G20RikD3Z741 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms