Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf217D3YYI7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf217D3YYI7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf217D3YYI7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf217D3YYI7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf217D3YYI7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf217D3YYI7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf217D3YYI7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf217D3YYI7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf217D3YYI7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf217D3YYI7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf217D3YYI7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf217D3YYI7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf217D3YYI7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf217D3YYI7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf217D3YYI7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf217D3YYI7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf217D3YYI7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf217D3YYI7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf217D3YYI7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf217D3YYI7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf217D3YYI7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf217D3YYI7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf217D3YYI7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnf217D3YYI7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnf217D3YYI7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnf217D3YYI7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf217D3YYI7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf217D3YYI7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf217D3YYI7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf217D3YYI7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf217D3YYI7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf217D3YYI7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf217D3YYI7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf217D3YYI7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf217D3YYI7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf217D3YYI7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf217D3YYI7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf217D3YYI7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf217D3YYI7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf217D3YYI7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf217D3YYI7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf217D3YYI7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf217D3YYI7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf217D3YYI7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf217D3YYI7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf217D3YYI7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf217D3YYI7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf217D3YYI7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf217D3YYI7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf217D3YYI7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf217D3YYI7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf217D3YYI7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf217D3YYI7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf217D3YYI7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf217D3YYI7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf217D3YYI7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf217D3YYI7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf217D3YYI7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf217D3YYI7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf217D3YYI7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf217D3YYI7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf217D3YYI7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf217D3YYI7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnf217D3YYI7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf217D3YYI7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf217D3YYI7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf217D3YYI7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf217D3YYI7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf217D3YYI7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf217D3YYI7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf217D3YYI7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf217D3YYI7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf217D3YYI7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf217D3YYI7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf217D3YYI7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf217D3YYI7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf217D3YYI7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf217D3YYI7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf217D3YYI7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf217D3YYI7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf217D3YYI7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf217D3YYI7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf217D3YYI7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf217D3YYI7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf217D3YYI7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf217D3YYI7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf217D3YYI7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf217D3YYI7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf217D3YYI7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf217D3YYI7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf217D3YYI7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf217D3YYI7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf217D3YYI7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf217D3YYI7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf217D3YYI7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf217D3YYI7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf217D3YYI7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf217D3YYI7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf217D3YYI7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms