Protein–RNA interactions for Protein: D3YUR1

4930444P10Rik, RIKEN cDNA 4930444P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444P10RikD3YUR1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930444P10RikD3YUR1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930444P10RikD3YUR1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930444P10RikD3YUR1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930444P10RikD3YUR1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930444P10RikD3YUR1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930444P10RikD3YUR1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930444P10RikD3YUR1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930444P10RikD3YUR1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930444P10RikD3YUR1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4930444P10RikD3YUR1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930444P10RikD3YUR1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4930444P10RikD3YUR1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4930444P10RikD3YUR1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930444P10RikD3YUR1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930444P10RikD3YUR1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930444P10RikD3YUR1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
4930444P10RikD3YUR1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms