Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm17333C6EQI3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm17333C6EQI3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm17333C6EQI3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm17333C6EQI3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm17333C6EQI3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm17333C6EQI3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm17333C6EQI3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm17333C6EQI3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm17333C6EQI3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm17333C6EQI3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm17333C6EQI3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm17333C6EQI3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm17333C6EQI3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm17333C6EQI3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm17333C6EQI3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm17333C6EQI3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm17333C6EQI3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm17333C6EQI3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm17333C6EQI3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm17333C6EQI3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm17333C6EQI3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm17333C6EQI3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm17333C6EQI3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm17333C6EQI3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm17333C6EQI3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm17333C6EQI3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm17333C6EQI3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm17333C6EQI3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm17333C6EQI3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm17333C6EQI3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm17333C6EQI3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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