Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rd3lB2RV38 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rd3lB2RV38 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rd3lB2RV38 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rd3lB2RV38 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rd3lB2RV38 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rd3lB2RV38 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rd3lB2RV38 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rd3lB2RV38 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rd3lB2RV38 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rd3lB2RV38 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rd3lB2RV38 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rd3lB2RV38 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rd3lB2RV38 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rd3lB2RV38 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rd3lB2RV38 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rd3lB2RV38 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rd3lB2RV38 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rd3lB2RV38 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rd3lB2RV38 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rd3lB2RV38 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms