Protein–RNA interactions for Protein: B1AX35

1700011M02Rik, RIKEN cDNA 1700011M02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700011M02RikB1AX35 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700011M02RikB1AX35 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700011M02RikB1AX35 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700011M02RikB1AX35 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700011M02RikB1AX35 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700011M02RikB1AX35 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700011M02RikB1AX35 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700011M02RikB1AX35 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700011M02RikB1AX35 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700011M02RikB1AX35 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700011M02RikB1AX35 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700011M02RikB1AX35 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700011M02RikB1AX35 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700011M02RikB1AX35 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700011M02RikB1AX35 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700011M02RikB1AX35 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700011M02RikB1AX35 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700011M02RikB1AX35 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700011M02RikB1AX35 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700011M02RikB1AX35 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700011M02RikB1AX35 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700011M02RikB1AX35 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700011M02RikB1AX35 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700011M02RikB1AX35 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700011M02RikB1AX35 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700011M02RikB1AX35 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700011M02RikB1AX35 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700011M02RikB1AX35 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700011M02RikB1AX35 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700011M02RikB1AX35 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700011M02RikB1AX35 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700011M02RikB1AX35 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700011M02RikB1AX35 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700011M02RikB1AX35 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700011M02RikB1AX35 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700011M02RikB1AX35 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700011M02RikB1AX35 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700011M02RikB1AX35 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700011M02RikB1AX35 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700011M02RikB1AX35 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700011M02RikB1AX35 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700011M02RikB1AX35 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700011M02RikB1AX35 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700011M02RikB1AX35 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700011M02RikB1AX35 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700011M02RikB1AX35 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
1700011M02RikB1AX35 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700011M02RikB1AX35 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700011M02RikB1AX35 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700011M02RikB1AX35 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700011M02RikB1AX35 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms