Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slfn8B1ARD8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slfn8B1ARD8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slfn8B1ARD8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slfn8B1ARD8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slfn8B1ARD8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slfn8B1ARD8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slfn8B1ARD8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfn8B1ARD8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfn8B1ARD8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfn8B1ARD8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfn8B1ARD8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfn8B1ARD8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfn8B1ARD8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn8B1ARD8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn8B1ARD8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn8B1ARD8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn8B1ARD8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn8B1ARD8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfn8B1ARD8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfn8B1ARD8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfn8B1ARD8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfn8B1ARD8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfn8B1ARD8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfn8B1ARD8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfn8B1ARD8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slfn8B1ARD8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slfn8B1ARD8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfn8B1ARD8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfn8B1ARD8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfn8B1ARD8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slfn8B1ARD8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slfn8B1ARD8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn8B1ARD8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn8B1ARD8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn8B1ARD8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn8B1ARD8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn8B1ARD8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn8B1ARD8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slfn8B1ARD8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slfn8B1ARD8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slfn8B1ARD8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slfn8B1ARD8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slfn8B1ARD8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slfn8B1ARD8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slfn8B1ARD8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slfn8B1ARD8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slfn8B1ARD8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slfn8B1ARD8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slfn8B1ARD8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slfn8B1ARD8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slfn8B1ARD8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slfn8B1ARD8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slfn8B1ARD8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slfn8B1ARD8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slfn8B1ARD8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slfn8B1ARD8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slfn8B1ARD8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slfn8B1ARD8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slfn8B1ARD8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slfn8B1ARD8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slfn8B1ARD8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slfn8B1ARD8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slfn8B1ARD8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slfn8B1ARD8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slfn8B1ARD8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slfn8B1ARD8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slfn8B1ARD8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slfn8B1ARD8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slfn8B1ARD8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slfn8B1ARD8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slfn8B1ARD8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slfn8B1ARD8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slfn8B1ARD8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slfn8B1ARD8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slfn8B1ARD8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slfn8B1ARD8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Slfn8B1ARD8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Slfn8B1ARD8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slfn8B1ARD8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slfn8B1ARD8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slfn8B1ARD8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slfn8B1ARD8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slfn8B1ARD8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slfn8B1ARD8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slfn8B1ARD8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slfn8B1ARD8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slfn8B1ARD8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slfn8B1ARD8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slfn8B1ARD8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slfn8B1ARD8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slfn8B1ARD8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slfn8B1ARD8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slfn8B1ARD8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slfn8B1ARD8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slfn8B1ARD8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slfn8B1ARD8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slfn8B1ARD8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slfn8B1ARD8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slfn8B1ARD8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms