Protein–RNA interactions for Protein: A9C473

A630010A05Rik, RIKEN cDNA A630010A05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A630010A05RikA9C473 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A630010A05RikA9C473 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A630010A05RikA9C473 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A630010A05RikA9C473 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A630010A05RikA9C473 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A630010A05RikA9C473 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A630010A05RikA9C473 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A630010A05RikA9C473 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A630010A05RikA9C473 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A630010A05RikA9C473 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A630010A05RikA9C473 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
A630010A05RikA9C473 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A630010A05RikA9C473 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A630010A05RikA9C473 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A630010A05RikA9C473 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A630010A05RikA9C473 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A630010A05RikA9C473 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A630010A05RikA9C473 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A630010A05RikA9C473 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A630010A05RikA9C473 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
A630010A05RikA9C473 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A630010A05RikA9C473 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
A630010A05RikA9C473 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A630010A05RikA9C473 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A630010A05RikA9C473 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A630010A05RikA9C473 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A630010A05RikA9C473 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A630010A05RikA9C473 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A630010A05RikA9C473 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A630010A05RikA9C473 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A630010A05RikA9C473 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A630010A05RikA9C473 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A630010A05RikA9C473 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A630010A05RikA9C473 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A630010A05RikA9C473 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A630010A05RikA9C473 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A630010A05RikA9C473 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
A630010A05RikA9C473 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A630010A05RikA9C473 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A630010A05RikA9C473 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A630010A05RikA9C473 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A630010A05RikA9C473 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A630010A05RikA9C473 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A630010A05RikA9C473 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A630010A05RikA9C473 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
A630010A05RikA9C473 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A630010A05RikA9C473 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A630010A05RikA9C473 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A630010A05RikA9C473 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A630010A05RikA9C473 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A630010A05RikA9C473 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A630010A05RikA9C473 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A630010A05RikA9C473 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A630010A05RikA9C473 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A630010A05RikA9C473 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A630010A05RikA9C473 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A630010A05RikA9C473 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A630010A05RikA9C473 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A630010A05RikA9C473 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A630010A05RikA9C473 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A630010A05RikA9C473 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A630010A05RikA9C473 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A630010A05RikA9C473 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A630010A05RikA9C473 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A630010A05RikA9C473 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A630010A05RikA9C473 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
A630010A05RikA9C473 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A630010A05RikA9C473 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
A630010A05RikA9C473 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A630010A05RikA9C473 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A630010A05RikA9C473 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A630010A05RikA9C473 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
A630010A05RikA9C473 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A630010A05RikA9C473 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A630010A05RikA9C473 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A630010A05RikA9C473 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A630010A05RikA9C473 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A630010A05RikA9C473 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A630010A05RikA9C473 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A630010A05RikA9C473 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A630010A05RikA9C473 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A630010A05RikA9C473 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A630010A05RikA9C473 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A630010A05RikA9C473 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A630010A05RikA9C473 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A630010A05RikA9C473 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A630010A05RikA9C473 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A630010A05RikA9C473 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A630010A05RikA9C473 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A630010A05RikA9C473 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A630010A05RikA9C473 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A630010A05RikA9C473 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A630010A05RikA9C473 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A630010A05RikA9C473 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A630010A05RikA9C473 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
A630010A05RikA9C473 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A630010A05RikA9C473 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A630010A05RikA9C473 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A630010A05RikA9C473 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A630010A05RikA9C473 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms