Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc9bA3KGF9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc9bA3KGF9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc9bA3KGF9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc9bA3KGF9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc9bA3KGF9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc9bA3KGF9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc9bA3KGF9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc9bA3KGF9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc9bA3KGF9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc9bA3KGF9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc9bA3KGF9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc9bA3KGF9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc9bA3KGF9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc9bA3KGF9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc9bA3KGF9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc9bA3KGF9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc9bA3KGF9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc9bA3KGF9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc9bA3KGF9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc9bA3KGF9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc9bA3KGF9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc9bA3KGF9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc9bA3KGF9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc9bA3KGF9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc9bA3KGF9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc9bA3KGF9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc9bA3KGF9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc9bA3KGF9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc9bA3KGF9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc9bA3KGF9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc9bA3KGF9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc9bA3KGF9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc9bA3KGF9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc9bA3KGF9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc9bA3KGF9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc9bA3KGF9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc9bA3KGF9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc9bA3KGF9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc9bA3KGF9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc9bA3KGF9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc9bA3KGF9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc9bA3KGF9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc9bA3KGF9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc9bA3KGF9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc9bA3KGF9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc9bA3KGF9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc9bA3KGF9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc9bA3KGF9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc9bA3KGF9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc9bA3KGF9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc9bA3KGF9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc9bA3KGF9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc9bA3KGF9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc9bA3KGF9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc9bA3KGF9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc9bA3KGF9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc9bA3KGF9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc9bA3KGF9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc9bA3KGF9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc9bA3KGF9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc9bA3KGF9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc9bA3KGF9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc9bA3KGF9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc9bA3KGF9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc9bA3KGF9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc9bA3KGF9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc9bA3KGF9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc9bA3KGF9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc9bA3KGF9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc9bA3KGF9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc9bA3KGF9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc9bA3KGF9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc9bA3KGF9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc9bA3KGF9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc9bA3KGF9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc9bA3KGF9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc9bA3KGF9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc9bA3KGF9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc9bA3KGF9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc9bA3KGF9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc9bA3KGF9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc9bA3KGF9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc9bA3KGF9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc9bA3KGF9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc9bA3KGF9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc9bA3KGF9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc9bA3KGF9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc9bA3KGF9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc9bA3KGF9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc9bA3KGF9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc9bA3KGF9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc9bA3KGF9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc9bA3KGF9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc9bA3KGF9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc9bA3KGF9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc9bA3KGF9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc9bA3KGF9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc9bA3KGF9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc9bA3KGF9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms