Protein–RNA interactions for Protein: A2ARJ3

Tmem236, Transmembrane protein 236, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem236A2ARJ3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem236A2ARJ3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem236A2ARJ3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem236A2ARJ3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem236A2ARJ3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem236A2ARJ3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem236A2ARJ3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem236A2ARJ3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem236A2ARJ3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem236A2ARJ3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem236A2ARJ3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem236A2ARJ3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem236A2ARJ3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem236A2ARJ3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem236A2ARJ3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem236A2ARJ3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem236A2ARJ3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem236A2ARJ3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem236A2ARJ3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem236A2ARJ3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem236A2ARJ3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem236A2ARJ3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem236A2ARJ3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem236A2ARJ3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem236A2ARJ3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem236A2ARJ3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem236A2ARJ3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem236A2ARJ3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem236A2ARJ3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem236A2ARJ3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem236A2ARJ3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem236A2ARJ3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem236A2ARJ3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem236A2ARJ3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem236A2ARJ3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem236A2ARJ3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem236A2ARJ3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem236A2ARJ3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem236A2ARJ3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem236A2ARJ3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem236A2ARJ3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem236A2ARJ3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem236A2ARJ3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem236A2ARJ3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem236A2ARJ3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem236A2ARJ3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem236A2ARJ3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem236A2ARJ3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem236A2ARJ3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem236A2ARJ3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem236A2ARJ3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem236A2ARJ3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem236A2ARJ3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem236A2ARJ3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem236A2ARJ3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem236A2ARJ3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem236A2ARJ3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem236A2ARJ3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem236A2ARJ3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem236A2ARJ3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem236A2ARJ3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem236A2ARJ3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem236A2ARJ3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem236A2ARJ3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem236A2ARJ3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem236A2ARJ3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem236A2ARJ3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem236A2ARJ3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem236A2ARJ3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem236A2ARJ3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem236A2ARJ3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem236A2ARJ3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem236A2ARJ3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem236A2ARJ3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem236A2ARJ3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem236A2ARJ3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem236A2ARJ3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem236A2ARJ3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem236A2ARJ3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem236A2ARJ3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem236A2ARJ3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem236A2ARJ3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem236A2ARJ3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem236A2ARJ3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem236A2ARJ3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem236A2ARJ3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem236A2ARJ3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem236A2ARJ3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem236A2ARJ3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem236A2ARJ3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem236A2ARJ3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem236A2ARJ3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem236A2ARJ3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem236A2ARJ3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem236A2ARJ3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem236A2ARJ3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem236A2ARJ3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tmem236A2ARJ3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem236A2ARJ3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem236A2ARJ3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms