Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FocadA2AKG8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FocadA2AKG8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FocadA2AKG8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FocadA2AKG8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
FocadA2AKG8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FocadA2AKG8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FocadA2AKG8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FocadA2AKG8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FocadA2AKG8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FocadA2AKG8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
FocadA2AKG8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
FocadA2AKG8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FocadA2AKG8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FocadA2AKG8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FocadA2AKG8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FocadA2AKG8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FocadA2AKG8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
FocadA2AKG8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FocadA2AKG8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FocadA2AKG8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FocadA2AKG8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FocadA2AKG8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
FocadA2AKG8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FocadA2AKG8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FocadA2AKG8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FocadA2AKG8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FocadA2AKG8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FocadA2AKG8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FocadA2AKG8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FocadA2AKG8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FocadA2AKG8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FocadA2AKG8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FocadA2AKG8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FocadA2AKG8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FocadA2AKG8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FocadA2AKG8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FocadA2AKG8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FocadA2AKG8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FocadA2AKG8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FocadA2AKG8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
FocadA2AKG8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FocadA2AKG8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FocadA2AKG8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FocadA2AKG8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
FocadA2AKG8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FocadA2AKG8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FocadA2AKG8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
FocadA2AKG8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FocadA2AKG8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FocadA2AKG8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FocadA2AKG8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FocadA2AKG8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FocadA2AKG8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FocadA2AKG8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FocadA2AKG8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FocadA2AKG8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
FocadA2AKG8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FocadA2AKG8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FocadA2AKG8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FocadA2AKG8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FocadA2AKG8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FocadA2AKG8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FocadA2AKG8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FocadA2AKG8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FocadA2AKG8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FocadA2AKG8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FocadA2AKG8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FocadA2AKG8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FocadA2AKG8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FocadA2AKG8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FocadA2AKG8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FocadA2AKG8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FocadA2AKG8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FocadA2AKG8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FocadA2AKG8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FocadA2AKG8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FocadA2AKG8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
FocadA2AKG8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FocadA2AKG8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FocadA2AKG8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FocadA2AKG8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FocadA2AKG8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FocadA2AKG8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FocadA2AKG8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
FocadA2AKG8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
FocadA2AKG8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FocadA2AKG8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FocadA2AKG8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
FocadA2AKG8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FocadA2AKG8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FocadA2AKG8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FocadA2AKG8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
FocadA2AKG8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FocadA2AKG8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FocadA2AKG8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FocadA2AKG8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FocadA2AKG8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FocadA2AKG8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FocadA2AKG8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms