Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ambra1A2AH22 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ambra1A2AH22 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ambra1A2AH22 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ambra1A2AH22 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ambra1A2AH22 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Ambra1A2AH22 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ambra1A2AH22 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ambra1A2AH22 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Ambra1A2AH22 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ambra1A2AH22 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ambra1A2AH22 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ambra1A2AH22 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ambra1A2AH22 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ambra1A2AH22 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ambra1A2AH22 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ambra1A2AH22 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ambra1A2AH22 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ambra1A2AH22 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ambra1A2AH22 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ambra1A2AH22 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Ambra1A2AH22 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ambra1A2AH22 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ambra1A2AH22 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Ambra1A2AH22 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ambra1A2AH22 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ambra1A2AH22 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ambra1A2AH22 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ambra1A2AH22 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ambra1A2AH22 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ambra1A2AH22 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ambra1A2AH22 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ambra1A2AH22 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ambra1A2AH22 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ambra1A2AH22 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ambra1A2AH22 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ambra1A2AH22 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ambra1A2AH22 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ambra1A2AH22 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ambra1A2AH22 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ambra1A2AH22 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ambra1A2AH22 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ambra1A2AH22 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ambra1A2AH22 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ambra1A2AH22 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ambra1A2AH22 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ambra1A2AH22 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ambra1A2AH22 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ambra1A2AH22 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ambra1A2AH22 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ambra1A2AH22 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ambra1A2AH22 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ambra1A2AH22 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ambra1A2AH22 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ambra1A2AH22 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ambra1A2AH22 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ambra1A2AH22 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ambra1A2AH22 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ambra1A2AH22 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ambra1A2AH22 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ambra1A2AH22 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ambra1A2AH22 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ambra1A2AH22 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ambra1A2AH22 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ambra1A2AH22 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ambra1A2AH22 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ambra1A2AH22 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ambra1A2AH22 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ambra1A2AH22 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ambra1A2AH22 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ambra1A2AH22 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ambra1A2AH22 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ambra1A2AH22 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ambra1A2AH22 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ambra1A2AH22 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ambra1A2AH22 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ambra1A2AH22 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ambra1A2AH22 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ambra1A2AH22 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ambra1A2AH22 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ambra1A2AH22 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ambra1A2AH22 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ambra1A2AH22 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ambra1A2AH22 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ambra1A2AH22 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ambra1A2AH22 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ambra1A2AH22 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ambra1A2AH22 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ambra1A2AH22 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ambra1A2AH22 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ambra1A2AH22 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ambra1A2AH22 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ambra1A2AH22 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ambra1A2AH22 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ambra1A2AH22 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ambra1A2AH22 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ambra1A2AH22 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ambra1A2AH22 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ambra1A2AH22 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ambra1A2AH22 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.2 ms