Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ckap5A2AGT5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ckap5A2AGT5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ckap5A2AGT5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ckap5A2AGT5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ckap5A2AGT5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ckap5A2AGT5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ckap5A2AGT5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ckap5A2AGT5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ckap5A2AGT5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ckap5A2AGT5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ckap5A2AGT5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ckap5A2AGT5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ckap5A2AGT5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ckap5A2AGT5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ckap5A2AGT5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ckap5A2AGT5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ckap5A2AGT5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ckap5A2AGT5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ckap5A2AGT5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ckap5A2AGT5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ckap5A2AGT5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ckap5A2AGT5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ckap5A2AGT5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ckap5A2AGT5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ckap5A2AGT5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ckap5A2AGT5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ckap5A2AGT5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ckap5A2AGT5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ckap5A2AGT5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ckap5A2AGT5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ckap5A2AGT5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ckap5A2AGT5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ckap5A2AGT5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ckap5A2AGT5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ckap5A2AGT5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ckap5A2AGT5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ckap5A2AGT5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ckap5A2AGT5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ckap5A2AGT5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ckap5A2AGT5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ckap5A2AGT5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ckap5A2AGT5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ckap5A2AGT5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ckap5A2AGT5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ckap5A2AGT5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ckap5A2AGT5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ckap5A2AGT5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ckap5A2AGT5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ckap5A2AGT5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ckap5A2AGT5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ckap5A2AGT5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ckap5A2AGT5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ckap5A2AGT5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ckap5A2AGT5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ckap5A2AGT5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ckap5A2AGT5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ckap5A2AGT5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ckap5A2AGT5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ckap5A2AGT5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ckap5A2AGT5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ckap5A2AGT5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ckap5A2AGT5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ckap5A2AGT5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ckap5A2AGT5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ckap5A2AGT5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ckap5A2AGT5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ckap5A2AGT5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ckap5A2AGT5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ckap5A2AGT5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ckap5A2AGT5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ckap5A2AGT5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ckap5A2AGT5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ckap5A2AGT5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ckap5A2AGT5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ckap5A2AGT5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ckap5A2AGT5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ckap5A2AGT5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ckap5A2AGT5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ckap5A2AGT5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ckap5A2AGT5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ckap5A2AGT5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ckap5A2AGT5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ckap5A2AGT5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ckap5A2AGT5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ckap5A2AGT5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ckap5A2AGT5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ckap5A2AGT5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ckap5A2AGT5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ckap5A2AGT5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ckap5A2AGT5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ckap5A2AGT5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ckap5A2AGT5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ckap5A2AGT5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ckap5A2AGT5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ckap5A2AGT5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ckap5A2AGT5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ckap5A2AGT5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ckap5A2AGT5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ckap5A2AGT5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 220.3 ms