Protein–RNA interactions for Protein: A2ACP1

Ttc39a, Tetratricopeptide repeat protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39aA2ACP1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc39aA2ACP1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc39aA2ACP1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc39aA2ACP1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc39aA2ACP1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc39aA2ACP1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc39aA2ACP1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc39aA2ACP1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc39aA2ACP1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc39aA2ACP1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc39aA2ACP1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc39aA2ACP1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc39aA2ACP1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc39aA2ACP1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc39aA2ACP1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc39aA2ACP1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc39aA2ACP1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc39aA2ACP1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc39aA2ACP1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc39aA2ACP1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc39aA2ACP1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc39aA2ACP1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc39aA2ACP1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc39aA2ACP1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc39aA2ACP1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc39aA2ACP1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc39aA2ACP1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc39aA2ACP1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc39aA2ACP1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc39aA2ACP1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc39aA2ACP1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc39aA2ACP1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc39aA2ACP1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc39aA2ACP1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc39aA2ACP1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc39aA2ACP1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc39aA2ACP1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc39aA2ACP1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc39aA2ACP1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc39aA2ACP1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc39aA2ACP1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc39aA2ACP1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc39aA2ACP1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc39aA2ACP1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc39aA2ACP1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc39aA2ACP1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc39aA2ACP1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc39aA2ACP1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc39aA2ACP1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc39aA2ACP1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc39aA2ACP1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc39aA2ACP1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc39aA2ACP1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc39aA2ACP1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc39aA2ACP1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc39aA2ACP1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc39aA2ACP1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc39aA2ACP1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc39aA2ACP1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc39aA2ACP1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc39aA2ACP1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc39aA2ACP1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc39aA2ACP1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc39aA2ACP1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc39aA2ACP1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc39aA2ACP1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc39aA2ACP1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc39aA2ACP1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc39aA2ACP1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc39aA2ACP1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc39aA2ACP1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc39aA2ACP1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc39aA2ACP1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc39aA2ACP1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc39aA2ACP1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc39aA2ACP1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc39aA2ACP1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc39aA2ACP1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc39aA2ACP1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc39aA2ACP1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc39aA2ACP1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc39aA2ACP1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc39aA2ACP1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc39aA2ACP1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc39aA2ACP1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc39aA2ACP1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc39aA2ACP1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc39aA2ACP1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc39aA2ACP1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc39aA2ACP1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc39aA2ACP1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc39aA2ACP1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc39aA2ACP1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc39aA2ACP1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc39aA2ACP1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc39aA2ACP1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc39aA2ACP1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc39aA2ACP1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc39aA2ACP1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc39aA2ACP1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms