Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdc27A2A6Q5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdc27A2A6Q5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdc27A2A6Q5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdc27A2A6Q5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdc27A2A6Q5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdc27A2A6Q5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdc27A2A6Q5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdc27A2A6Q5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdc27A2A6Q5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdc27A2A6Q5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdc27A2A6Q5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdc27A2A6Q5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdc27A2A6Q5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdc27A2A6Q5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdc27A2A6Q5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdc27A2A6Q5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdc27A2A6Q5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdc27A2A6Q5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdc27A2A6Q5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdc27A2A6Q5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdc27A2A6Q5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdc27A2A6Q5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdc27A2A6Q5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdc27A2A6Q5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdc27A2A6Q5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdc27A2A6Q5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdc27A2A6Q5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdc27A2A6Q5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cdc27A2A6Q5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdc27A2A6Q5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdc27A2A6Q5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdc27A2A6Q5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdc27A2A6Q5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdc27A2A6Q5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdc27A2A6Q5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdc27A2A6Q5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdc27A2A6Q5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdc27A2A6Q5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdc27A2A6Q5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdc27A2A6Q5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdc27A2A6Q5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdc27A2A6Q5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdc27A2A6Q5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdc27A2A6Q5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdc27A2A6Q5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdc27A2A6Q5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdc27A2A6Q5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdc27A2A6Q5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdc27A2A6Q5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdc27A2A6Q5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdc27A2A6Q5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdc27A2A6Q5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdc27A2A6Q5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdc27A2A6Q5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdc27A2A6Q5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdc27A2A6Q5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdc27A2A6Q5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdc27A2A6Q5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdc27A2A6Q5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdc27A2A6Q5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdc27A2A6Q5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdc27A2A6Q5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdc27A2A6Q5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdc27A2A6Q5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdc27A2A6Q5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdc27A2A6Q5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdc27A2A6Q5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdc27A2A6Q5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdc27A2A6Q5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdc27A2A6Q5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdc27A2A6Q5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdc27A2A6Q5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdc27A2A6Q5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdc27A2A6Q5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdc27A2A6Q5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdc27A2A6Q5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdc27A2A6Q5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdc27A2A6Q5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdc27A2A6Q5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdc27A2A6Q5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdc27A2A6Q5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdc27A2A6Q5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdc27A2A6Q5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdc27A2A6Q5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdc27A2A6Q5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdc27A2A6Q5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdc27A2A6Q5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdc27A2A6Q5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdc27A2A6Q5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdc27A2A6Q5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdc27A2A6Q5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdc27A2A6Q5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdc27A2A6Q5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdc27A2A6Q5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdc27A2A6Q5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdc27A2A6Q5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdc27A2A6Q5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdc27A2A6Q5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdc27A2A6Q5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms