Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cul4bA2A432 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cul4bA2A432 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cul4bA2A432 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cul4bA2A432 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cul4bA2A432 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cul4bA2A432 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cul4bA2A432 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cul4bA2A432 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cul4bA2A432 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cul4bA2A432 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cul4bA2A432 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cul4bA2A432 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cul4bA2A432 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cul4bA2A432 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cul4bA2A432 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cul4bA2A432 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cul4bA2A432 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cul4bA2A432 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cul4bA2A432 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cul4bA2A432 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cul4bA2A432 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cul4bA2A432 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cul4bA2A432 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cul4bA2A432 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cul4bA2A432 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cul4bA2A432 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cul4bA2A432 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cul4bA2A432 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul4bA2A432 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul4bA2A432 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul4bA2A432 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul4bA2A432 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul4bA2A432 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul4bA2A432 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul4bA2A432 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul4bA2A432 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul4bA2A432 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cul4bA2A432 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cul4bA2A432 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cul4bA2A432 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cul4bA2A432 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cul4bA2A432 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cul4bA2A432 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cul4bA2A432 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Cul4bA2A432 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cul4bA2A432 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cul4bA2A432 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cul4bA2A432 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cul4bA2A432 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cul4bA2A432 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cul4bA2A432 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cul4bA2A432 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cul4bA2A432 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cul4bA2A432 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cul4bA2A432 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cul4bA2A432 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cul4bA2A432 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cul4bA2A432 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cul4bA2A432 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cul4bA2A432 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cul4bA2A432 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cul4bA2A432 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cul4bA2A432 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cul4bA2A432 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cul4bA2A432 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cul4bA2A432 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul4bA2A432 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul4bA2A432 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul4bA2A432 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul4bA2A432 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul4bA2A432 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul4bA2A432 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul4bA2A432 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul4bA2A432 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul4bA2A432 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul4bA2A432 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Cul4bA2A432 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul4bA2A432 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul4bA2A432 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul4bA2A432 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul4bA2A432 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul4bA2A432 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul4bA2A432 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul4bA2A432 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul4bA2A432 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul4bA2A432 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cul4bA2A432 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cul4bA2A432 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cul4bA2A432 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cul4bA2A432 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cul4bA2A432 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cul4bA2A432 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cul4bA2A432 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul4bA2A432 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul4bA2A432 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul4bA2A432 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cul4bA2A432 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cul4bA2A432 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cul4bA2A432 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms