Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trav12-2A0N8N6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trav12-2A0N8N6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trav12-2A0N8N6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trav12-2A0N8N6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trav12-2A0N8N6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trav12-2A0N8N6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trav12-2A0N8N6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trav12-2A0N8N6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trav12-2A0N8N6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trav12-2A0N8N6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trav12-2A0N8N6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trav12-2A0N8N6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trav12-2A0N8N6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trav12-2A0N8N6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trav12-2A0N8N6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trav12-2A0N8N6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trav12-2A0N8N6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trav12-2A0N8N6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trav12-2A0N8N6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trav12-2A0N8N6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trav12-2A0N8N6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trav12-2A0N8N6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trav12-2A0N8N6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trav12-2A0N8N6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trav12-2A0N8N6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trav12-2A0N8N6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trav12-2A0N8N6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trav12-2A0N8N6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trav12-2A0N8N6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trav12-2A0N8N6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trav12-2A0N8N6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trav12-2A0N8N6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trav12-2A0N8N6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trav12-2A0N8N6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trav12-2A0N8N6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trav12-2A0N8N6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trav12-2A0N8N6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trav12-2A0N8N6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trav12-2A0N8N6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trav12-2A0N8N6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trav12-2A0N8N6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trav12-2A0N8N6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trav12-2A0N8N6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trav12-2A0N8N6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trav12-2A0N8N6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trav12-2A0N8N6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trav12-2A0N8N6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trav12-2A0N8N6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trav12-2A0N8N6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trav12-2A0N8N6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trav12-2A0N8N6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trav12-2A0N8N6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trav12-2A0N8N6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trav12-2A0N8N6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trav12-2A0N8N6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trav12-2A0N8N6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trav12-2A0N8N6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trav12-2A0N8N6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trav12-2A0N8N6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trav12-2A0N8N6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trav12-2A0N8N6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trav12-2A0N8N6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trav12-2A0N8N6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trav12-2A0N8N6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trav12-2A0N8N6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Trav12-2A0N8N6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trav12-2A0N8N6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trav12-2A0N8N6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trav12-2A0N8N6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trav12-2A0N8N6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trav12-2A0N8N6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trav12-2A0N8N6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trav12-2A0N8N6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trav12-2A0N8N6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trav12-2A0N8N6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trav12-2A0N8N6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Trav12-2A0N8N6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trav12-2A0N8N6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trav12-2A0N8N6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trav12-2A0N8N6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trav12-2A0N8N6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trav12-2A0N8N6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trav12-2A0N8N6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trav12-2A0N8N6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trav12-2A0N8N6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trav12-2A0N8N6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trav12-2A0N8N6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trav12-2A0N8N6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trav12-2A0N8N6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trav12-2A0N8N6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Trav12-2A0N8N6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trav12-2A0N8N6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trav12-2A0N8N6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trav12-2A0N8N6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trav12-2A0N8N6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trav12-2A0N8N6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trav12-2A0N8N6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trav12-2A0N8N6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Trav12-2A0N8N6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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