Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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